RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517483.5

TMPRSS4-202, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 2

Gene TMPRSS4, Length 2,074 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-202ENST00000517483 CD68P34810 354 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 PGGT1BP53609 377 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 BEX3Q00994 111 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 BST2Q10589 180 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 SNX17Q15036 470 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 OXA1LQ15070 435 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZBTB6Q15916 424 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 CYP2A13Q16696 494 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 LAYNQ6UX15 382 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 BNIPLQ7Z465 357 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 OMDQ99983 421 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 MROQ9BYG7 248 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 PSME2Q9UL46 239 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 NME7Q9Y5B8 376 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 CITO14578 2027 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 H0YAE9 185 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 NRP1O14786 923 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 NOS2P35228 1153 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ACADSBP45954 432 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 BCAT1P54687 386 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 NOGQ13253 232 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 NEDD8Q15843 81 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 CCDC80Q76M96 950 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 IGFN1Q86VF2 1251 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 TP53INP2Q8IXH6 220 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 C7orf31Q8N865 590 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZIC5Q96T25 663 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 OSMRQ99650 979 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMPRSS4-202ENST00000517483 CCDC78A2IDD5 438 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 FAM149AA5PLN7 773 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 EI24O14681 340 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 SEPT4O43236 478 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 CLIC3O95833 236 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 GPX3P22352 226 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 CDH17Q12864 832 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 NME3Q13232 169 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 ITGADQ13349 1161 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 PITRM1Q5JRX3 1037 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 CUZD1Q86UP6 607 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 RETREG3Q86VR2 466 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 UNC93AQ86WB7 457 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 SPPL2CQ8IUH8 684 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 LEMD2Q8NC56 503 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 OR9I1Q8NGQ6 314 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 HDAC10Q969S8 669 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 NT5C3BQ969T7 300 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZNF347Q96SE7 839 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 PSD2Q9BQI7 771 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 MUC13Q9H3R2 512 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 SPC25Q9HBM1 224 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 MAGEE1Q9HCI5 957 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZNF639Q9UID6 485 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.52□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 KRBA1A5PL33 1030 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 CAPN15O75808 1086 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 LCP1P13796 627 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 ARSAP15289 507 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 RFC2P35250 354 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 ETFBP38117 255 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 RPS9P46781 194 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 FLT3LGP49771 235 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 SULT1E1P49888 294 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 GNA12Q03113 381 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 ZNF460Q14592 562 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 TRIM16LQ309B1 348 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 XKR4Q5GH76 650 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 DDIASQ8IXT1 998 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 HEXDCQ8WVB3 486 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 TRIB2Q92519 343 aa14.51□□□□□ -0.09
TMPRSS4-202ENST00000517483 TAMM41Q96BW9 452 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms