RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503832.1

TBCK-208, Transcript of TBC1 domain containing kinase, human

TSL 5

Gene TBCK, Length 865 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCK-208	ENST00000503832	MMP2	P08253	660 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ECT2L	Q008S8	904 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FGF17	O60258	216 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ZG16	O60844	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CGA	P01215	116 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	POLB	P06746	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CD58	P19256	250 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	MCM3	P25205	808 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GPD2	P43304	727 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	SORD	Q00796	357 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	PPFIA1	Q13136	1202 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FBXL22	Q6P050	247 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TMEM160	Q9NX00	188 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TF	P02787	698 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FGF5	P12034	268 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GLIPR1	P48060	266 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ISL1	P61371	349 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	UFM1	P61960	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CCDC96	Q2M329	555 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	C11orf65	Q8NCR3	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ALG14	Q96F25	216 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GOLGA6L10	A0A0M3HER8	536 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FAM172BP	A6NC97	362 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CAPN9	O14815	690 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	MYOD1	P15172	320 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	S1PR1	P21453	382 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FMO5	P49326	533 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	CLCNKA	P51800	687 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GALNT2	Q10471	571 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TMEM255B	Q8WV15	326 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	MMP25	Q9NPA2	562 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GGA3	Q9NZ52	723 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TBCK-208	ENST00000503832	TAF1	P21675	1872 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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