RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492730.1

C4BPB-208, Transcript of complement component 4 binding protein beta, human

TSL 4

Gene C4BPB, Length 564 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C4BPB-208	ENST00000492730	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CPOX	P36551	454 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CD86	P42081	329 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MTHFR	P42898	656 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC1A2	P43004	574 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RGR	P47804	291 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINB8	P50452	374 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MNAT1	P51948	309 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	GEM	P55040	296 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TAS2R39	P59534	338 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	USP4	Q13107	963 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PEX6	Q13608	980 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SEMA3A	Q14563	771 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	VEPH1	Q14D04	833 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PTPRR	Q15256	657 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CNGA3	Q16281	694 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PCSK7	Q16549	785 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DBN1	Q16643	649 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	C5orf22	Q49AR2	442 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ATG16L1	Q676U5	607 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RTL10	Q7L3V2	364 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CD163	Q86VB7	1156 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MIB1	Q86YT6	1006 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	LZTR1	Q8N653	840 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ITFG1	Q8TB96	612 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SUSD6	Q92537	303 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CDKL2	Q92772	493 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FOXJ1	Q92949	421 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NXNL1	Q96CM4	212 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SERPINB11	Q96P15	392 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	IL22	Q9GZX6	179 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	POMK	Q9H5K3	350 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	EBF2	Q9HAK2	575 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	PDF	Q9HBH1	243 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	VPS45	Q9NRW7	570 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MCM8	Q9UJA3	840 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM50B	Q9Y247	325 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	YIPF1	Q9Y548	306 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	MYO9B	Q13459	2157 aa		5.84	□□□□□ -1.47
C4BPB-208	ENST00000492730	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A0D9SEW6	157 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730		A0A1W2PRU2	124 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MAGEB16	A2A368	324 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	NEMP2	A6NFY4	417 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	MEI4	A8MW99	385 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730		B2RBV5	119 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ZNF197	O14709	1029 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ZMPSTE24	O75844	475 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KRT36	O76013	467 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ANXA9	O76027	345 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ANP32D	O95626	131 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CD160	O95971	181 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KLKB1	P03952	638 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TPBGL	P0DKB5	382 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	TACR2	P21452	398 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	SAT1	P21673	171 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CCND1	P24385	295 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	HOXA9	P31269	272 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	HTR7	P34969	479 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	ETFB	P38117	255 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	CCR2	P41597	374 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	GLRB	P48167	497 aa		5.83	□□□□□ -1.48
C4BPB-208	ENST00000492730	KCNC1	P48547	511 aa		5.83	□□□□□ -1.48

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