RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488612.5

RAD51B-212, Transcript of RAD51 paralog B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD51B, Length 1,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51B-212ENST00000488612 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 PRSS56P0CW18 603 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 MLNP12872 115 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 C6P13671 934 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 XPAP23025 273 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 NMBRP28336 390 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ETV3P41162 512 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ELK3P41970 407 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ARSDP51689 593 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TMPRSS15P98073 1019 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 HIF1AQ16665 826 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM52BQ4KMG9 183 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 Q6ZVL8 140 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 USP45Q70EL2 814 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 KBTBD6Q86V97 674 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC25Q86WR0 208 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ZBED8Q8IZ13 594 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 BBOF1Q8ND07 529 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 MFSD3Q96ES6 412 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 GPR174Q9BXC1 333 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 FZD3Q9NPG1 666 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 IL17CQ9P0M4 197 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 FZD4Q9ULV1 537 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SCML1Q9UN30 329 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM131Q92545 1883 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 LRP4O75096 1905 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1W2PQ67 120 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 A0A1W2PQU0 124 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 NEMP1O14524 444 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 RAD51BO15315 384 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 PIAS1O75925 651 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SEMA4FO95754 770 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 IGHV4-34P06331 123 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ELFN1P0C7U0 828 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 BPIP17213 487 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ARNTP27540 789 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TNFRSF8P28908 595 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CD6P30203 668 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 HMGCLP35914 325 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 NPY2RP49146 381 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 STC1P52823 247 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ARL4CP56559 192 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 GPX6P59796 221 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SARNPP82979 210 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CAV1Q03135 178 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ELP6Q0PNE2 266 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CUL1Q13616 776 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 PCID2Q5JVF3 399 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 ERAP2Q6P179 960 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 WDR93Q6P2C0 686 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 PDIK1LQ8N165 341 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 GPR26Q8NDV2 337 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 SCAMP4Q969E2 229 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 RAB7BQ96AH8 199 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 C9orf72Q96LT7 481 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 COQ10AQ96MF6 247 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 RANBP9Q96S59 729 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 AGAP2Q99490 1192 aa8.05□□□□□ -1.12
RAD51B-212ENST00000488612 FMO2Q99518 471 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms