RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486889.1

CTPS1-210, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CTPS1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-210ENST00000486889 HORMAD1Q86X24 394 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 LMNTD2Q8IXW0 634 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CALML6Q8TD86 181 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GAB3Q8WWW8 586 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ASB12Q8WXK4 309 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SEC14L1Q92503 715 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CDKL2Q92772 493 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SERPINB12Q96P63 405 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 APOL2Q9BQE5 337 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC77Q9BR77 488 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FAM86C1Q9NVL1 165 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 B4GALT6Q9UBX8 382 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SUSD2Q9UGT4 822 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RIMKLBQ9ULI2 386 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FAM169AQ9Y6X4 670 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NCOR1O75376 2440 aa9.76□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 K7ESF4 209 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FPGTO14772 594 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 AREL1O15033 823 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GJB3O75712 270 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FSBPO95073 299 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ALPIP09923 528 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RALBP11234 206 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PGAM1P18669 254 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 KELP23276 732 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 HTR1BP28222 390 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TNFRSF8P28908 595 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SPAM1P38567 509 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 STAT4Q14765 748 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC14Q15048 493 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TEAD4Q15561 434 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CCDC38Q502W7 563 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 LRRC66Q68CR7 880 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PDPK2PQ6A1A2 396 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MRNIPQ6NTE8 343 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CRTC1Q6UUV9 634 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF765Q7L2R6 523 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 RGL4Q8IZJ4 473 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 DENND6BQ8NEG7 585 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SNX19Q92543 992 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ULK4Q96C45 1275 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NUS1Q96E22 293 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GPR174Q9BXC1 333 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SLC17A9Q9BYT1 436 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FAM83DQ9H4H8 585 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CD248Q9HCU0 757 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GDF3Q9NR23 364 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 A0A1W2PQU0 124 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 A8MX80 341 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CFAP99D6REC4 459 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MMP20O60882 483 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 USP1O94782 785 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CLDN7O95471 211 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PRLP01236 227 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 C6P13671 934 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TSHRP16473 764 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 TPH1P17752 444 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 ITGALP20701 1170 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 IVDP26440 423 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 MGAT1P26572 445 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PMLP29590 882 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 CHRNA4P43681 627 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FNTBP49356 437 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 DCDC1P59894 354 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 PTK2BQ14289 1009 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 GPR33Q49SQ1 333 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 SPANXN3Q5MJ09 141 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 WDR93Q6P2C0 686 aa9.74□□□□□ -0.85
CTPS1-210ENST00000486889 AFTPHQ6ULP2 937 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms