RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KDELC1Q6UW63 502 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DBX2Q6ZNG2 339 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 NUS1Q96E22 293 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 FCRL5Q96RD9 977 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 GORASP1Q9BQQ3 440 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.52■■□□□ 1.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PCDHGA12O60330 932 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SDC3O75056 442 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CDK18Q07002 472 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 Q6ZVL8 140 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC35B2Q8TB61 432 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC110Q8TBZ0 833 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SAP25Q8TEE9 199 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 DTD2Q96FN9 168 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ADGRE3Q9BY15 652 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 GBA3Q9H227 469 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM153AQ9UHL3 310 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 DNPEPQ9ULA0 475 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 OR1A2Q9Y585 309 aa26.51■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 K7ESM1 405 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMD11O00231 422 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CLDN7O95471 211 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PIRTP0C851 137 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PTSQ03393 145 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 IFT43Q96FT9 208 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 LYSMD1Q96S90 227 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 FERMT1Q9BQL6 677 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SCN8AQ9UQD0 1980 aa26.5■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ENC1O14682 589 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 FLRT2O43155 660 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CXCR5P32302 372 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 STC1P52823 247 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 THOP1P52888 689 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 WNT3AP56704 352 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 YPEL5P62699 121 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 MTM1Q13496 603 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CDKN3Q16667 212 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF569Q5MCW4 686 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 NYAP1Q6ZVC0 841 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC35F6Q8N357 371 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 MRGPRX2Q96LB1 330 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SPATA13Q96N96 652 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 APOOQ9BUR5 198 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 DNAJC28Q9NX36 388 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CD84Q9UIB8 345 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 KLF15Q9UIH9 416 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SPTBN2O15020 2390 aa26.49■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 YKT6O15498 198 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 KIF5CO60282 957 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 NDST3O95803 873 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ITGAVP06756 1048 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF30P17039 623 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PSMB4P28070 264 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PARGQ86W56 976 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM121Q9BTD3 319 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC32A1Q9H598 525 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CBFA2T3O75081 653 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 STK10O94804 968 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 GDF10P55107 478 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 MACC1Q6ZN28 852 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 IPMKQ8NFU5 416 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 C1orf54Q8WWF1 131 aa26.48■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 TOR1BO14657 336 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CEACAM1P13688 526 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CHRNA4P43681 627 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PTK2BQ14289 1009 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PNCKQ6P2M8 343 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 RHBDD1Q8TEB9 315 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ABCG8Q9H221 673 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 UCKL1Q9NWZ5 548 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.47■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C4-202ENST00000483873 LIASO43766 372 aa26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms