RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CIB1Q99828 191 aa16.6■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LGALS13Q9UHV8 139 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXO10Q9UK96 956 aa16.6■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0J9YYE9 177 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9IYK1 514 aa16.6■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP1B1Q16678 543 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD9Q8NE22 299 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL1A2P08123 1366 aa16.6■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF39Q9H2S5 420 aa16.6■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNU1A8MYU2 1149 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOWAHAQ2M3V2 549 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XKR6Q5GH73 641 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC35B2Q8TB61 432 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AIF1P55008 147 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2A13Q16696 494 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF536O15090 1300 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCATO75600 419 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TM7SF2O76062 418 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RALGPS1Q5JS13 557 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPP5Q8N3R9 675 aa16.59■□□□□ 0.25
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FANCGO15287 622 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HCRTO43612 131 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WBP4O75554 376 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PKMP14618 531 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AQP1P29972 269 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HPCAL1P37235 193 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOVP48745 357 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VPS26BQ4G0F5 336 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATAD3BQ5T9A4 648 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM47BQ8NA70 645 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NMUR1Q9HB89 426 aa16.58■□□□□ 0.25
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