RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482871.5

MSL3-215, Transcript of MSL complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSL3, Length 834 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3-215ENST00000482871 NOTCH4Q99466 2003 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 O00370 1275 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CCL16O15467 120 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PRPSAP2O60256 369 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TLR5O60602 858 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TBX10O75333 385 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SPAG6O75602 509 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 RFPL2O75678 378 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SUN1O94901 812 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SEC24AO95486 1093 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 ERBB2P04626 1255 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 GSTA1P08263 222 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CD8BP10966 210 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 BRAFP15056 766 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 GPD1P21695 349 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 DRD4P21917 467 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CYP2F1P24903 491 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SDHAP31040 664 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PCK1P35558 622 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CHKAP35790 457 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PIK3CBP42338 1070 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CASP2P42575 452 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CDKN2BP42772 138 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PRIM2P49643 509 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 RAD23BP54727 409 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 EPHB3P54753 998 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TWF1Q12792 350 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PLD1Q13393 1074 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 KRT81Q14533 505 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 RASA2Q15283 850 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CNGA2Q16280 664 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TAF12Q16514 161 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CCDC142Q17RM4 750 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 C2CD6Q53TS8 623 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PITRM1Q5JRX3 1037 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 MFSD7Q6UXD7 560 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 BBS12Q6ZW61 710 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 VSIG1Q86XK7 387 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TDRPQ86YL5 185 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SCN4BQ8IWT1 228 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 ELMOD1Q8N336 334 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 C12orf29Q8N999 325 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 ASB11Q8WXH4 323 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PCED1BQ96HM7 432 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TWNKQ96RR1 684 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SMC6Q96SB8 1091 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PKMYT1Q99640 499 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 FERMT1Q9BQL6 677 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CNPY3Q9BT09 278 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CD244Q9BZW8 370 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 VPS11Q9H270 941 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 SAYSD1Q9NPB0 183 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 DMRT3Q9NQL9 472 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 MARCH2Q9P0N8 246 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 HSFX1Q9UBD0 423 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 HESX1Q9UBX0 185 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 FETUBQ9UGM5 382 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 CAPN7Q9Y6W3 813 aa8.09□□□□□ -1.11
MSL3-215ENST00000482871 TMEM82A0PJX8 343 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 TMEM120BA0PK00 339 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 F8VP50 259 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 CLDN5O00501 218 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 SOAT2O75908 522 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 VNN2O95498 520 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 IFNB1P01574 187 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 APOC2P02655 101 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 CCDC130P13994 396 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 IVDP26440 423 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 ADORA2BP29275 332 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 MAGEA11P43364 429 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 GABRB2P47870 512 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 SLC18A1P54219 525 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 SLC8A3P57103 927 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 IKZF1Q13422 519 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 VEPH1Q14D04 833 aa8.08□□□□□ -1.12
MSL3-215ENST00000482871 PDK2Q15119 407 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms