RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 ITGB7P26010 798 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRKCI-202ENST00000476635 MAXP61244 160 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRKCI-202ENST00000476635 CCDC126Q96EE4 140 aa6.44□□□□□ -1.38
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