RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	AMT	P48728	403 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	GLUD2	P49448	558 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PMS2	P54278	862 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CREB5	Q02930	508 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SGCD	Q92629	289 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZPBP	Q9BS86	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1W2PQF6	199 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	IKBKB	O14920	756 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	SLC25A12	O75746	678 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFB4	O95168	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ITGB6	P18564	788 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PSMB10	P40306	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HADHA	P40939	763 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	PCYT1A	P49585	367 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	F2RL1	P55085	397 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ABAT	P80404	500 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MC1R	Q01726	317 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	HNF4G	Q14541	408 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	WTAP	Q15007	396 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TOMM20	Q15388	145 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	KRT24	Q2M2I5	525 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	NME8	Q8N427	588 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MEIS3	Q99687	375 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM51	Q9NW97	253 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CLK1-208	ENST00000464454	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	SCAMP1	O15126	338 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	NDUFS3	O75489	264 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	NKX2-2	O95096	273 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CD58	P19256	250 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CHAT	P28329	748 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	UBA7	P41226	1012 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CDH8	P55286	799 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	ZXDB	P98169	803 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	LTB	Q06643	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	ACVR2B	Q13705	512 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	NEDD9	Q14511	834 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	KCTD2	Q14681	263 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	HLF	Q16534	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CALML4	Q96GE6	196 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	C1orf74	Q96LT6	269 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454		A0A1B0GVM2	712 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	AGAP14	A8MT82	685 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454		A8MZ25	164 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CLK1-208	ENST00000464454	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74

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