RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463006.5

CNOT10-208, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 10, human

TSL 3

Gene CNOT10, Length 692 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT10-208	ENST00000463006	ETFDH	Q16134	617 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	LETM2	Q2VYF4	491 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MMP21	Q8N119	569 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	OR2A14	Q96R47	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GAD1	Q99259	594 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IFNL4	K9M1U5	179 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PRY	O14603	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MOSPD3	O75425	235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	B3GALNT1	O75752	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NKX2-2	O95096	273 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IL1A	P01583	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TF	P02787	698 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MC5R	P33032	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	AMPH	P49418	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CCR3	P51677	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF131	P52739	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KCNB1	Q14721	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DPP10	Q8N608	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TC2N	Q8N9U0	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KRT35	Q92764	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MR1	Q95460	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PTER	Q96BW5	349 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006		Q9N2J8	555 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TADA2A	O75478	443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FCGR2A	P12318	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ACTN1	P12814	892 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	P4HA1	P13674	534 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	EDN2	P20800	178 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	FPR3	P25089	353 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	KIF5B	P33176	963 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	VPS41	P49754	854 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RAB28	P51157	221 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARSF	P54793	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CFHR3	Q02985	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	DMWD	Q09019	674 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	NAB2	Q15742	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	PMS2CL	Q68D20	193 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	OTOA	Q7RTW8	1153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CNOT10-208	ENST00000463006	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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