RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.4□□□□□ -0.9
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SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
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SH3BP4-208ENST00000462602 C1orf210Q8IVY1 113 aa9.4□□□□□ -0.9
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SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFS2O75306 463 aa9.38□□□□□ -0.91
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SH3BP4-208ENST00000462602 NUDT1P36639 197 aa9.38□□□□□ -0.91
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