RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 STK10O94804 968 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF30P17039 623 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SPINK2P20155 84 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ETV3P41162 512 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TPRG1LQ5T0D9 272 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RAET1GQ6H3X3 334 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SLCO6A1Q86UG4 719 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SLC25A45Q8N413 288 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CNTD1Q8N815 330 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PLA2G15Q8NCC3 412 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 OR4C6Q8NH72 309 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CCHCR1Q8TD31 782 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 COQ10AQ96MF6 247 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 GLOD4Q9HC38 313 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SCAMP1O15126 338 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SIGLEC6O43699 453 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 FZD6O60353 706 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RASGRP1O95267 797 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TSHRP16473 764 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CKMT2P17540 419 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 LHCGRP22888 699 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PTPN3P26045 913 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SKOR1P84550 965 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SHC2P98077 582 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ADCY2Q08462 1091 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 DNAJC3Q13217 504 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 GALNT3Q14435 633 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PNCKQ6P2M8 343 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PID1Q7Z2X4 250 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RBFAQ8N0V3 343 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 DTD2Q96FN9 168 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.871e-7■■■■■ 43.9
SCAF8-204ENST00000461219 VAT1Q99536 393 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.5■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PMPCBO75439 489 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RFPL3O75679 317 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TNFP01375 233 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ANXA6P08133 673 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC175P0C221 793 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 GPR1P46091 355 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SRP54P61011 504 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 XRCC4Q13426 336 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PTPRRQ15256 657 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ELOCQ15369 112 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TCEA2Q15560 299 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 Q6ZVL8 140 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 GLMNQ92990 594 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 AP2M1Q96CW1 435 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TEKT5Q96M29 485 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ALS2CR12Q96Q35 445 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CD84Q9UIB8 345 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.49■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 A0A0U1RQJ8 604 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM38O00635 465 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 SLC4A1P02730 911 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 MMP2P08253 660 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PYGMP11217 842 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CDK4P11802 303 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 PTPN7P35236 360 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 HK3P52790 923 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA1024LP59773 190 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CDK18Q07002 472 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 C1orf61Q13536 156 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 FAM182AQ5T1J6 154 aa20.48■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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