RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 SAP25Q8TEE9 199 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SMIM14Q96QK8 99 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 FCRL5Q96RD9 977 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 APOOQ9BUR5 198 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CARD9Q9H257 536 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.44■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 F5H423 210 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GIPC1O14908 333 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ETV3P41162 512 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.021e-7■■■■□ 26.3
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF542PQ5EBM4 170 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ATL2Q8NHH9 583 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CCHCR1Q8TD31 782 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TADA1Q96BN2 335 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 DTD2Q96FN9 168 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.43■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 A0A0U1RQS6 177 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6BA6NDN3 693 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 H3BM21 787 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SDC3O75056 442 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CLDN7O95471 211 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 NDST3O95803 873 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GM2AP17900 193 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PTSQ03393 145 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 MPP3Q13368 585 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PRPSAP1Q14558 356 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PNCKQ6P2M8 343 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 MACC1Q6ZN28 852 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 Q6ZVL8 140 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TRIB3Q96RU7 358 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 LYSMD1Q96S90 227 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CDC6Q99741 560 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 OR1A2Q9Y585 309 aa21.42■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ANXA9O76027 345 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CSF2P04141 144 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 JUNDP17535 347 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GEMP55040 296 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 WNT3AP56704 352 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 HS1BP3Q53T59 392 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ENPP7Q6UWV6 458 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 IPMKQ8NFU5 416 aa21.41■■□□□ 1.02
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ABCD4-202ENST00000460308 TLR10Q9BXR5 811 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 GBA3Q9H227 469 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 USP29Q9HBJ7 922 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.41■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 NME1P15531 152 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TSHRP16473 764 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 KELP23276 732 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 DGKAP23743 735 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 MSNP26038 577 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 STC1P52823 247 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PPARDQ03181 441 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 NFATC4Q14934 902 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 FAXCQ5TGI0 409 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 REXO1L1PQ8IX06 675 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 EID2Q8N6I1 236 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 FAM71DQ8N9W8 422 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 BTN2A2Q8WVV5 523 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 AP2M1Q96CW1 435 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SPATA13Q96N96 652 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 FSD1LQ9BXM9 530 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 WDR26Q9H7D7 661 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 MAGEE1Q9HCI5 957 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 PKD2L2Q9NZM6 624 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 CD84Q9UIB8 345 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SPTBN2O15020 2390 aa21.4■■□□□ 1.02
ABCD4-202ENST00000460308 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 NEMP2A6NFY4 417 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 CBFA2T3O75081 653 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 PIAS2O75928 621 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 EPOP01588 193 aa21.39■■□□□ 1.01
ABCD4-202ENST00000460308 C1SP09871 688 aa21.39■■□□□ 1.01
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