RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 JRKLQ9Y4A0 524 aa16.87■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 PMPCBO75439 489 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ANXA9O76027 345 aa16.86■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 ITGAVP06756 1048 aa16.86■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM14Q96QK8 99 aa16.86■□□□□ 0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.86■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 HTR1BP28222 390 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 ETV3P41162 512 aa16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 PPM1JQ5JR12 505 aa16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 ATL2Q8NHH9 583 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 CCHCR1Q8TD31 782 aa16.85■□□□□ 0.29
RABGEF1-204ENST00000442563 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.85■□□□□ 0.29
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RABGEF1-204ENST00000442563 KELP23276 732 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 DGKAP23743 735 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SPINT3P49223 89 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 BLKP51451 505 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 KIAA1024LP59773 190 aa16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
RABGEF1-204ENST00000442563 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.83■□□□□ 0.28
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