RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 TRIM48Q8IWZ4 208 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CLRN3Q8NCR9 226 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IPMKQ8NFU5 416 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OR7G2Q8NG99 324 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC20A1Q8WUM9 679 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TADA1Q96BN2 335 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IFT43Q96FT9 208 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GHITMQ9H3K2 345 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LRRC40Q9H9A6 602 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RSAD1Q9HA92 442 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF556Q9HAH1 456 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CYP26B1Q9NR63 512 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TUBG2Q9NRH3 451 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LUZP4Q9P127 313 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TRPV2Q9Y5S1 764 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CYTIPO60759 359 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VAPBO95292 243 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LDLRP01130 860 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GLDCP23378 1020 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CASP1P29466 404 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CCR9P51686 369 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PEX3P56589 373 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MAPK7Q13164 816 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 LLGL1Q15334 1064 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PSMD5Q16401 504 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FAM111BQ6SJ93 734 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ABTB2Q8N961 1025 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 KCT2Q8NC54 265 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ST7LQ8TDW4 575 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RAD51AP1Q96B01 352 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GLT1D1Q96MS3 346 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 AP1S3Q96PC3 154 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ADAM33Q9BZ11 813 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC19A3Q9BZV2 496 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MMP27Q9H306 513 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 IL1RL2Q9HB29 575 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SPACA1Q9HBV2 294 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MAP10Q9P2G4 905 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MGAT4AQ9UM21 535 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ICKQ9UPZ9 632 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ACTL7BQ9Y614 415 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DISP3Q9P2K9 1392 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 A0A0A0MRY4 1105 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MED24O75448 989 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GCNT3O95395 438 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ANGPTL1O95841 491 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM6P0DI80 62 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 PROZP22891 400 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MAGEA12P43365 314 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CTAG1AP78358 180 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.513e-36■■■■■ 51.8
PTPRC-209ENST00000442510 HIF1AQ16665 826 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 VMACQ2NL98 169 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FAM124AQ86V42 546 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 FANCBQ8NB91 859 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 OR2L8Q8NGY9 312 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 COQ8AQ8NI60 647 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NEUROD4Q9HD90 331 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RASSF1Q9NS23 344 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 INTS13Q9NVM9 706 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 STK32BQ9NY57 414 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CUX2O14529 1486 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 BTBD17A6NE02 478 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 L7N2F9 121 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 NEMP1O14524 444 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 MYL9P24844 172 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 GRIA1P42261 906 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ETV3LQ6ZN32 361 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 CREB3L2Q70SY1 520 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 UBR7Q8N806 425 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRC-209ENST00000442510 ACTRT1Q8TDG2 376 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms