RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CMKLR1Q99788 373 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TRIM4Q9C037 500 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 STARD5Q9NSY2 213 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 DONSONQ9NYP3 566 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 DOCK4Q8N1I0 1966 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 WASH4PA8MWX3 477 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 EFSO43281 561 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GCATO75600 419 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TMCC1O94876 653 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PROSCO94903 275 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 IGSF6O95976 241 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 UGT2B4P06133 528 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 RARAP10276 462 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 HK3P52790 923 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PDX1P52945 283 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CDH6P55285 790 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 RHOAP61586 193 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 C1orf61Q13536 156 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GRM3Q14832 879 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 BOLA3Q53S33 107 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 EXD3Q8N9H8 876 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CCDC74AQ96AQ1 378 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 EXOC2Q96KP1 924 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 B3GNT4Q9C0J1 378 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KLC2Q9H0B6 622 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SP110Q9HB58 689 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 LZTFL1Q9NQ48 299 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GPR34Q9UPC5 381 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KIF26BQ2KJY2 2108 aa11.74□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 RCCD1A6NED2 376 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 AREL1O15033 823 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TNNT1P13805 278 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PNLIPP16233 465 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 AMPD1P23109 780 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KELP23276 732 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GKP32189 559 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 IGFALSP35858 605 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ABL2P42684 1182 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KIF5AQ12840 1032 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SERINC3Q13530 473 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 LRRC14Q15048 493 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 DPYSL2Q16555 572 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 MYLK3Q32MK0 819 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CFAP58Q5T655 872 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 HID1Q8IV36 788 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 REXO1L1PQ8IX06 675 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 NPWQ8N729 165 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KCTD6Q8NC69 237 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PCDH19Q8TAB3 1148 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SLC35G2Q8TBE7 412 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 HCAR2Q8TDS4 363 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TEKT4Q8WW24 435 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 LACRTQ9GZZ8 138 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 LRRN3Q9H3W5 708 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SIRPGQ9P1W8 387 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 DKK3Q9UBP4 350 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 PISDQ9UG56 409 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 INTUQ9ULD6 942 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.73□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ESPNB1AK53 854 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 J3KR12 359 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CD160O95971 181 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TNFP01375 233 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GLB1P16278 677 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP25P42331 645 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 NOP2P46087 812 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ATP1A2P50993 1020 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 NDST2P52849 883 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 MMRN1Q13201 1228 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 DPYSQ14117 519 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF7Q14155 803 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 NFATC4Q14934 902 aa11.72□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms