RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HES2Q9Y543 173 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SYCE1LA8MT33 242 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GRID2O43424 1007 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 STAM2O75886 525 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGNO95427 931 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CALB1P05937 261 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HTR1BP28222 390 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RBL1P28749 1068 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NKX3-2P78367 333 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R2BQ00005 443 aa8.42□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CYBRD1Q53TN4 286 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GADL1Q6ZQY3 521 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HACE1Q8IYU2 909 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SFRP1Q8N474 314 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 POC5Q8NA72 575 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T3Q8NH03 318 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 JOSD2Q8TAC2 188 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TOP1MTQ969P6 601 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM213AQ9BRX8 229 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CD320Q9NPF0 282 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ADPRHL2Q9NX46 363 aa8.42□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR27A2RRH5 827 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 VWA5AO00534 786 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD51BO15315 384 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM13O60858 407 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXC6P09630 235 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSAP15289 507 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SPNP16150 400 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TNNI1P19237 187 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CD40LGP29965 261 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GALNSP34059 522 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC26A2P50443 739 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL14P50914 215 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 GALK2Q01415 458 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CUL2Q13617 745 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBA3CQ13748 450 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 NOMO1Q15155 1222 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 LYPD8Q6UX82 237 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 OSTM1Q86WC4 334 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 DACH2Q96NX9 599 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CITED4Q96RK1 184 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MXRA8Q9BRK3 442 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 B3GNT4Q9C0J1 378 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 G3V2L1 256 aa8.41□□□□□ -1.06
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RABGEF1-203ENST00000439720 ADCK1Q86TW2 530 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC103Q8IW40 242 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DDIASQ8IXT1 998 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ATL1Q8WXF7 558 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFYVE19Q96K21 471 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 MUS81Q96NY9 551 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-203ENST00000439720 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
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