RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434030.1

SEMA3B-205, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 3

Gene SEMA3B, Length 1,011 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-205ENST00000434030 PSMD11O00231 422 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 HLA-DQB2P05538 268 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ETV3P41162 512 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC1A1P43005 524 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 MAGEA1P43355 309 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 RPIAP49247 311 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 ARHGEF7Q14155 803 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TCEA2Q15560 299 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 LRRC38Q5VT99 294 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 USP45Q70EL2 814 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.15■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 MAPK15Q8TD08 544 aa22.15■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 DTD2Q96FN9 168 aa22.15■■□□□ 1.14
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SEMA3B-205ENST00000434030 HYOU1Q9Y4L1 999 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 TTLL3Q9Y4R7 772 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 AK5Q9Y6K8 562 aa22.15■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.14■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 LAMA5O15230 3695 aa22.14■■□□□ 1.14
SEMA3B-205ENST00000434030 A0A0U1RQS6 177 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TNFRSF10CO14798 259 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TGM2P21980 687 aa22.14■■□□□ 1.13
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SEMA3B-205ENST00000434030 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PERM1Q5SV97 790 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 Q6ZVL8 140 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 GKN2Q86XP6 184 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 SMIM14Q96QK8 99 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 WDR26Q9H7D7 661 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 FGF22Q9HCT0 170 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PADI4Q9UM07 663 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 CHKBQ9Y259 395 aa22.14■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 A0A0J9YYE9 177 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 KCNK1O00180 336 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 APOL1O14791 398 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PRLP01236 227 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 JCHAINP01591 159 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TRBC1P01850 177 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TNNT1P13805 278 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 COMTP21964 271 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 CRTC1Q6UUV9 634 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RHOT1Q8IXI2 618 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 DEPDC7Q96QD5 511 aa22.13■■□□□ 1.13
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SEMA3B-205ENST00000434030 TEX101Q9BY14 249 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 GULP1Q9UBP9 304 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 DSPP15924 2871 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 LCA5LO95447 670 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 KRT1P04264 644 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 KRT10P13645 584 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 EPHB1P54762 984 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 HADHBP55084 474 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PTSQ03393 145 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 LRRC66Q68CR7 880 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 NPNTQ6UXI9 565 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 NAT6Q93015 286 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RBSNQ9H1K0 784 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 SIRPGQ9P1W8 387 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 GPR34Q9UPC5 381 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 CHD6Q8TD26 2715 aa22.12■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 SPOPO43791 374 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 CSO75390 466 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 MMP2P08253 660 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 DPTQ07507 201 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 ZBTB17Q13105 803 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 ODF2Q5BJF6 829 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 HEATR4Q86WZ0 1026 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 RFX6Q8HWS3 928 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 CNTD1Q8N815 330 aa22.11■■□□□ 1.13
SEMA3B-205ENST00000434030 ARL10Q8N8L6 244 aa22.11■■□□□ 1.13
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