RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427230.2

NANOGP4-201, Transcript of Nanog homeobox pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene NANOGP4, Length 913 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP4-201ENST00000427230 IL27RAQ6UWB1 636 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 LRRC31Q6UY01 552 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MLKLQ8NB16 471 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 CXorf38Q8TB03 319 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 NRG4Q8WWG1 115 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 FATE1Q969F0 183 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 CALML4Q96GE6 196 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF560Q96MR9 790 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 FAM213AQ9BRX8 229 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SOX7Q9BT81 388 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 LINC00597Q9H2U6 94 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 DMRT3Q9NQL9 472 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ANLNQ9NQW6 1124 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 TBC1D7Q9P0N9 293 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GCNT4Q9P109 453 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SIX4Q9UIU6 781 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GTF3C4Q9UKN8 822 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 INTUQ9ULD6 942 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 AGAP1Q9UPQ3 857 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 KCTD3Q9Y597 815 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 PLXNA2O75051 1894 aa5.75□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 PTPRJQ12913 1337 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ITIH6Q6UXX5 1313 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 NUMA1Q14980 2115 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SVILO95425 2214 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MED13LQ71F56 2210 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 APCP25054 2843 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GOLGA8IPA6NC78 632 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GOLGA8JA6NMD2 632 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 VSTM5A8MXK1 200 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP2C2O75185 946 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 IL18RAPO95256 599 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 KRT19P08727 400 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 C1SP09871 688 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 LMO2P25791 158 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 UBA7P41226 1012 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 TSPY1Q01534 308 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MORC3Q14149 939 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 CASP8Q14790 479 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 WDR45BQ5MNZ6 344 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 EOGTQ5NDL2 527 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 PRR31Q5SQ13 230 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 NXNQ6DKJ4 435 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SHC4Q6S5L8 630 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF720Q7Z2F6 126 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 TICAM1Q8IUC6 712 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 BRSK2Q8IWQ3 736 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 RASSF8Q8NHQ8 419 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 KCNE4Q8WWG9 221 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ATP2A3Q93084 1043 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MYLPFQ96A32 169 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 CCDC34Q96HJ3 373 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 EPSTI1Q96J88 318 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 AK8Q96MA6 479 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SPATA25Q9BR10 227 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ACBD6Q9BR61 282 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 CBWD1Q9BRT8 395 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 STRA6Q9BX79 667 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 DPH1Q9BZG8 443 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MTMR12Q9C0I1 747 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 TMEM206Q9H813 350 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 PDE11AQ9HCR9 933 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 CD93Q9NPY3 652 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 VPS18Q9P253 973 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 NME7Q9Y5B8 376 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 SNX9Q9Y5X1 595 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ABCA2Q9BZC7 2435 aa5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
NANOGP4-201ENST00000427230 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms