RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 COLGALT2Q8IYK4 626 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TIFAQ96CG3 184 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 NXNL1Q96CM4 212 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PANX1Q96RD7 426 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF180Q9UJW8 692 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM30Q9UKF2 790 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SPESP1Q6UW49 350 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MPP4Q96JB8 637 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa21.42■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 GNA12Q03113 381 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PPM1JQ5JR12 505 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ARL8BQ9NVJ2 186 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MYL12BO14950 172 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 AMD1P17707 334 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 STYXQ8WUJ0 223 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF516Q92618 1163 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TBATAQ96M53 351 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZW10O43264 779 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A3O75751 556 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 FGF19O95750 216 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 UGT2B4P06133 528 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CXCR3P49682 368 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 LIMK2P53671 638 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 DGKKQ5KSL6 1271 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 HEXDCQ8WVB3 486 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC9A7Q96T83 725 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TGDSO95455 350 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PIGRP01833 764 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 HTR1BP28222 390 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC7A2P52569 658 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 DLG2Q15700 870 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TCAF1Q9Y4C2 921 aa21.41■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 OR52E6Q96RD3 313 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 NMUR2Q9GZQ4 415 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM25AB3EWG3 89 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM25CB3EWG5 89 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM25GB3EWG6 89 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 UMPSP11172 480 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CLNKQ7Z7G1 428 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 GRIP2Q9C0E4 1043 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 FZD10Q9ULW2 581 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF232Q9UNY5 417 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAP12Q02952 1782 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CCR4P51679 360 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CHN2P52757 468 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP78Q5JTW2 689 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TRAF7Q6Q0C0 670 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CRTC3Q6UUV7 619 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 LINGO4Q6UY18 593 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ASZ1Q8WWH4 475 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SNX10Q9Y5X0 201 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A1B0GVM2 712 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 TCAF2A6NFQ2 919 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 LRATO95237 230 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 GPD2P43304 727 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLAIN1Q8ND83 568 aa21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 RFXANKO14593 260 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 CDH4P55283 916 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MPP1Q00013 466 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC51AQ86UW1 340 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 OR7D4Q8NG98 312 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEH1Q9H213 219 aa21.39■■□□□ 1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 STMN3Q9NZ72 180 aa21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms