RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409402.8

SPIRE1-202, Transcript of spire type actin nucleation factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPIRE1, Length 5,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1-202ENST00000409402 TRIM16LQ309B1 348 aa25.08■■□□□ 1.61
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SPIRE1-202ENST00000409402 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa25.08■■□□□ 1.61
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SPIRE1-202ENST00000409402 SEC13P55735 322 aa25.08■■□□□ 1.61
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SPIRE1-202ENST00000409402 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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SPIRE1-202ENST00000409402 OR8H2Q8N162 312 aa25.06■■□□□ 1.6
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SPIRE1-202ENST00000409402 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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SPIRE1-202ENST00000409402 TPSAB1Q15661 275 aa25.05■■□□□ 1.6
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