RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 DLG3Q92796 817 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PRDM12Q9H4Q4 367 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 RAP2CQ9Y3L5 183 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 RAD54BQ9Y620 910 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM88BA6NKF7 163 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 MATN1P21941 496 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 OPRL1P41146 370 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SULT1E1P49888 294 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 MPP1Q00013 466 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 REP15Q6BDI9 236 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF534Q76KX8 674 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TAS2R42Q7RTR8 314 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 NRBF2Q96F24 287 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 P2RY11Q96G91 374 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 GLT1D1Q96MS3 346 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TCF12Q99081 682 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 RAD21L1Q9H4I0 556 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 MGAMO43451 1857 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 KANSL1LA0AUZ9 987 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 M0QYT0 321 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 AURKAO14965 403 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ATP6V1B2P21281 511 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SERPINB1P30740 379 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 OR1G1P47890 313 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TRPC1P48995 793 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PRKAA1Q13131 559 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 STX5Q13190 355 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PDK2Q15119 407 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 FAM214AQ32MH5 1076 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 KIAA0319Q5VV43 1072 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 IPMKQ8NFU5 416 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SOCS4Q8WXH5 440 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ZFYVE19Q96K21 471 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TBCBQ99426 244 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 FTHL17Q9BXU8 183 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 NFKBIZQ9BYH8 718 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PLK2Q9NYY3 685 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 BTRCQ9Y297 605 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TAF4O00268 1085 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF195O14628 629 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 AP1G1O43747 822 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 MFSD11O43934 449 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PGAM1P18669 254 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 OXTRP30559 389 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TKTL1P51854 596 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 DAB2P98082 770 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 KCNJ8Q15842 424 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 CAMK1DQ8IU85 385 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 CCDC103Q8IW40 242 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 HBEGFQ99075 208 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ZBED2Q9BTP6 218 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 GIN1Q9NXP7 522 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 COMMD10Q9Y6G5 202 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PLXNB2O15031 1838 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TCAF2A6NFQ2 919 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TSPAN3O60637 253 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 CCDC153Q494R4 210 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 BOLA3Q53S33 107 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 LCLAT1Q6UWP7 414 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 AGMOQ6ZNB7 445 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SLCO6A1Q86UG4 719 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 CYP3A43Q9HB55 503 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ZBTB26Q9HCK0 441 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 VPS45Q9NRW7 570 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TMEM30AQ9NV96 361 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 DTLQ9NZJ0 730 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 COL1A2P08123 1366 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 H3BMM5 538 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SNX2O60749 519 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 IST1P53990 364 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PRKAA2P54646 552 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 PFKPQ01813 784 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 RHDQ02161 417 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 NFATC3Q12968 1075 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 DEFB115Q30KQ5 88 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TIGD5Q53EQ6 642 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 CRTC3Q6UUV7 619 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 SCAMP5Q8TAC9 235 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 VPS33AQ96AX1 596 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 DACH2Q96NX9 599 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 ULBP1Q9BZM6 244 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 TRIM39Q9HCM9 518 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRN-202ENST00000409251 MRGBPQ9NV56 204 aa12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms