RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTAGE9A4FU28 777 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC30A4O14863 429 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMD3O43242 534 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDF9O60383 454 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGF1P05230 155 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PYGLP06737 847 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PSMB4P28070 264 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TEAD1P28347 426 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGFALSP35858 605 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RXRGP48443 463 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STC1P52823 247 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDF10P55107 478 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDN2P57739 230 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTSQ03393 145 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DPTQ07507 201 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GALNT3Q14435 633 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IRF4Q15306 451 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC1A5Q15758 541 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDKN3Q16667 212 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAYNQ6UX15 382 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPAN33Q86UF1 283 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC89Q8N998 374 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IPMKQ8NFU5 416 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR13H1Q8NG92 308 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUS1Q96E22 293 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FSCN3Q9NQT6 498 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBP1Q9NZI7 540 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HACD3Q9P035 362 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAK5Q9P286 719 aa15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POM121BA6NF01 834 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C4orf47A7E2U8 309 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A8MX80 341 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H0Y8X5 98 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCDHGA12O60330 932 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNB1P01574 187 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSHRP16473 764 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GM2AP17900 193 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FDFT1P37268 417 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCT8P50990 548 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEMG2Q02383 582 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNX1Q13596 522 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP1B1Q16678 543 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RANBP10Q6VN20 620 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PARGQ86W56 976 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRELID2Q8N945 189 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATL2Q8NHH9 583 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COG1Q8WTW3 980 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WDR24Q96S15 920 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTKNQ9BST9 563 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC40Q9H9A6 602 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKD2L2Q9NZM6 624 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF14Q9UBS8 474 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CA5BQ9Y2D0 317 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.29■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GTQ1 180 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLDN7O95471 211 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTR1BP28222 390 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADRA1AP35348 466 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM23P36406 574 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETV3P41162 512 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 THOP1P52888 689 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INPP5AQ14642 412 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIRPB2Q5JXA9 342 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q6ZVL8 140 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMC3Q7Z5M5 1100 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C19orf43Q9BQ61 176 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TM7SF3Q9NS93 570 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF711Q9Y462 761 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SAR1BQ9Y6B6 198 aa15.28■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPFIA2O75334 1257 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 METTL18O95568 372 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP2A1O95782 977 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCCBP05166 539 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1SP09871 688 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KELP23276 732 aa15.27■□□□□ 0.04
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGCLP35914 325 aa15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms