RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 OCIAD1Q9NX40 245 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC9A2Q9UBY0 812 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 ERVK-11Q9UQG0 969 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC28A2O43868 658 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFS7O75251 213 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 FTCDO95954 541 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 T-ENOLP0DO92 83 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGR1AP12314 374 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT10P13645 584 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 IL7RP16871 459 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 MAOAP21397 527 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK4P31152 587 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 STX2P32856 288 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 RAD23BP54727 409 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 DSCR9P59020 149 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 SETQ01105 290 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 DDR1Q08345 913 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 NFATC4Q14934 902 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 MED22Q15528 200 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 HLFQ16534 295 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT24Q2M2I5 525 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 AMZ1Q400G9 498 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 XKR9Q5GH70 373 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 TTI2Q6NXR4 508 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC13Q8IYE1 715 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 ADSSL1Q8N142 457 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 FRMD1Q8N878 549 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 RND1Q92730 232 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 EVPLQ92817 2033 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 MED30Q96HR3 178 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM68Q96MH6 324 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 FIZ1Q96SL8 496 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM47Q9BQJ4 181 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 IL25Q9H293 177 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 MUC13Q9H3R2 512 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 CNGB3Q9NQW8 809 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 SNX9Q9Y5X1 595 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 CKAP5Q14008 2032 aa3.9□□□□□ -1.78
RABGGTB-202ENST00000370826 LIPT2A6NK58 231 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE7O76087 117 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 NKX2-2O95096 273 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 MLYCDO95822 493 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE12FP0CL80 117 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE12GP0CL81 117 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE12IP0CL82 117 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMP2P13473 410 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 NFKBIAP25963 317 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 F2RL1P55085 397 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE1Q13065 139 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GAGE4Q13068 117 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 GGNBP1Q5YKI7 109 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF114Q8NC26 417 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 SCMH1Q96GD3 660 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3GL2Q99962 352 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 ITPAQ9BY32 194 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP25Q9NPA2 562 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 NOX4Q9NPH5 578 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT84Q9NSB2 600 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 EHD2Q9NZN4 543 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 TINAGQ9UJW2 476 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 SOCS6O14544 535 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGGTB-202ENST00000370826 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
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