RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 MTM1Q13496 603 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF7Q14155 803 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 MACC1Q6ZN28 852 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 GLRX5Q86SX6 157 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 SLCO6A1Q86UG4 719 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PNPLA1Q8N8W4 532 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 IFT43Q96FT9 208 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CD84Q9UIB8 345 aa27■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 NCOR2Q9Y618 2525 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM38O00635 465 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 FFAR2O15552 330 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PMPCBO75439 489 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 FTH1P19P0C7X4 201 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 RPL26P61254 145 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 FOXK2Q01167 660 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PTSQ03393 145 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 NFATC4Q14934 902 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CDKN3Q16667 212 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 INAVAQ3KP66 663 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF662Q6ZS27 426 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 LGR4Q9BXB1 951 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 LRRK1Q38SD2 2015 aa26.99■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PSMD11O00231 422 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 SCAMP1O15126 338 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 MTSS1O43312 755 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TJP3O95049 919 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CLDN7O95471 211 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PIRTP0C851 137 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 RBP3P10745 1247 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 JUNDP17535 347 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 SPINK2P20155 84 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CETN2P41208 172 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 KDELC1Q6UW63 502 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PID1Q7Z2X4 250 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PHACTR4Q8IZ21 702 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CDC6Q99741 560 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 GORASP1Q9BQQ3 440 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 FTSJ1Q9UET6 329 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 WASF3Q9UPY6 502 aa26.98■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ANKRD66B4E2M5 251 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TOR1BO14657 336 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 NFKBIAP25963 317 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 STC1P52823 247 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 DNAJC3Q13217 504 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PTK2BQ14289 1009 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ALG11Q2TAA5 492 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PNCKQ6P2M8 343 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFAF2Q8N183 169 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 LYSMD1Q96S90 227 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 KCNF1Q9H3M0 494 aa26.97■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TMEM202A6NGA9 273 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 CDK18Q07002 472 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf61Q13536 156 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 TCEA2Q15560 299 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 SLC14A2Q15849 920 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 MEI1Q5TIA1 1274 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ENPP7Q6UWV6 458 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 SCAMP4Q969E2 229 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 EID2BQ96D98 161 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 PDXPQ96GD0 296 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 FCRL5Q96RD9 977 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 VAT1Q99536 393 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 LRRC61Q9BV99 259 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 ABCG8Q9H221 673 aa26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
TPGS1-201ENST00000359315 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 TNFSF14O43557 240 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 SIGLEC6O43699 453 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 SOD1P00441 154 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 ZNF30P17039 623 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 TRIM23P36406 574 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 WNT3AP56704 352 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 LMX1AQ8TE12 382 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 AGAP2Q99490 1192 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 ADGRE3Q9BY15 652 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 WDR26Q9H7D7 661 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 FGF22Q9HCT0 170 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 FAM153AQ9UHL3 310 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 RSPH14Q9UHP6 348 aa26.95■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA6CA6NDK9 693 aa26.94■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 GOLGA6BA6NDN3 693 aa26.94■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 H3BM21 787 aa26.94■■□□□ 1.9
TPGS1-201ENST00000359315 KCNN4O15554 427 aa26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms