RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 DSC2Q02487 901 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RING1Q06587 406 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CYP2A13Q16696 494 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ALFQ53S48 1182 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM196Q5HYL7 178 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FSTL4Q6MZW2 842 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC81Q6ZN84 652 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf80Q86SX3 495 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ACTL9Q8TC94 416 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM74Q96NL1 305 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RAB17Q9H0T7 212 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VPS11Q9H270 941 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PHTF1Q9UMS5 762 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PRMT3O60678 531 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VPS26AO75436 327 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GCATO75600 419 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 HLA-FP30511 346 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MMRN1Q13201 1228 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SGO1Q5FBB7 561 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 AVL9Q8NBF6 648 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 MAGEC3Q8TD91 643 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 TNFRSF10BO14763 440 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FSCN2O14926 492 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 YKT6O15498 198 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GDF9O60383 454 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 PREPP48147 710 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 WNT3AP56704 352 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 S1PR5Q9H228 398 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FAM96AQ9H5X1 160 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PDE7BQ9NP56 450 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS16Q9NQE7 514 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 CD274Q9NZQ7 290 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 B4GALT6Q9UBX8 382 aa4.44□□□□□ -1.7
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