RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A36Q96CQ1 311 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SHISA4Q96DD7 197 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ZNF479Q96JC4 524 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 CCDC17Q96LX7 622 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 MED15Q96RN5 788 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ORAI2Q96SN7 254 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 CNPY3Q9BT09 278 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 CHID1Q9BWS9 393 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 RXFP1Q9HBX9 757 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TUBE1Q9UJT0 475 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TINAGQ9UJW2 476 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 USP21Q9UK80 565 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 GABRQQ9UN88 632 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 U3KQV3 271 aa6.98□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 VPS4BO75351 444 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 CH25HO95992 272 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 KRT8P05787 483 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 UROSP10746 265 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 BMP2P12643 396 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SAT1P21673 171 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TUBG1P23258 451 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 LCN1P31025 176 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 HOXA9P31269 272 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 PAFAH1B1P43034 410 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TGM3Q08188 693 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 STX5Q13190 355 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 IL18Q14116 193 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 HKDC1Q2TB90 917 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 STEAP3Q658P3 488 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ZNF573Q86YE8 665 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 EXD1Q8NHP7 514 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ZNF596Q8TC21 504 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 APBB2Q92870 758 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SPSB4Q96A44 273 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 APOLD1Q96LR9 279 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 FBXL18Q96ME1 805 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 HHIPQ96QV1 700 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 PKP2Q99959 881 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 BDH2Q9BUT1 245 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TLR10Q9BXR5 811 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 CHRDQ9H2X0 955 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ARMT1Q9H993 441 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TDP1Q9NUW8 608 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 MAU2Q9Y6X3 613 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 RAB19A4D1S5 217 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 PLK4O00444 970 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 AIM2O14862 343 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 AP5Z1O43299 807 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 DLX3O60479 287 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 GPX5O75715 221 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 UFL1O94874 794 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 ITGA2BP08514 1039 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 NPR1P16066 1061 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 EPORP19235 508 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 TNNI3P19429 210 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SREBF1P36956 1147 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 GRM5P41594 1212 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 FASLGP48023 281 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 GNG10P50151 68 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 WNT7BP56706 349 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 RAB4BP61018 213 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 CYP24A1Q07973 514 aa6.96□□□□□ -1.29
RRN3-202ENST00000327307 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
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