RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299162.9

FOXN4-201, Transcript of forkhead box N4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN4, Length 3,350 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4-201ENST00000299162 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 OXSMQ9NWU1 459 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MKS1Q9NXB0 559 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PPP6CO00743 305 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SBK3P0C264 359 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TM4SF4P48230 202 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ACTR3P61158 418 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DSC1Q08554 894 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TUBB3Q13509 450 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PPP1R3AQ16821 1122 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LIPMQ5VYY2 423 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RANBP10Q6VN20 620 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ACAD11Q709F0 780 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LZTR1Q8N653 840 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 APBB2Q92870 758 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NPAS2Q99743 824 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM62Q9BVG3 475 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 OSBPL10Q9BXB5 764 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MUC3BQ9H195 1237 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 S100A14Q9HCY8 104 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRPV5Q9NQA5 729 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CROTQ9UKG9 612 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SCML2Q9UQR0 700 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ARHGEF37A1IGU5 675 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 F5H5T6 163 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GSTT2P0CG29 244 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GSTT2BP0CG30 244 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RGRP47804 291 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RPL14P50914 215 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SGSHP51688 502 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TWF1Q12792 350 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KLF10Q13118 480 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 C6orf183Q5T699 404 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CYS1Q717R9 158 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LRRC43Q8N309 656 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NCSTNQ92542 709 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RCN3Q96D15 328 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 BTN2A3PQ96KV6 586 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TM6SF2Q9BZW4 377 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CREBZFQ9NS37 354 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 OAZ2O95190 189 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 COX4I1P13073 169 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC6A4P31645 630 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 STT3AP46977 705 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CDKN2DP55273 166 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NAB1Q13506 487 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 UGP2Q16851 508 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NADSYN1Q6IA69 706 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SCIMPQ6UWF3 145 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CEP295NLQ96MC4 621 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SLC25A51Q9H1U9 297 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ABCG8Q9H221 673 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CAAP1Q9H8G2 361 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 CCDC167Q9P0B6 97 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TRIM17Q9Y577 477 aa10.12□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 HEATR9A2RTY3 570 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 KLHL2O95198 593 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 COL6A2P12110 1019 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ITGB6P18564 788 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TACR2P21452 398 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 FMO4P31512 558 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 NAA20P61599 178 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 INSCQ1MX18 579 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 MANEALQ5VSG8 457 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 POTEHQ6S545 545 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 ZFP28Q8NHY6 868 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 WBP2Q969T9 261 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 LRGUKQ96M69 825 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 TSGA13Q96PP4 275 aa10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
FOXN4-201ENST00000299162 RAD54BQ9Y620 910 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 471.6 ms