RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 SNAP91O60641 907 aa20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ASZ1Q8WWH4 475 aa20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.39■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PTPRJQ12913 1337 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SLC35G4P0C7Q5 338 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 TCEA2Q15560 299 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 GSTA3Q16772 222 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PROSER1Q86XN7 944 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PLD4Q96BZ4 506 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SH3BGRLO75368 114 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 UQCRBP14927 111 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CCR3P51677 355 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CACNG1Q06432 222 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 INAQ16352 499 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 OR4K2Q8NGD2 314 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 MYL12BO14950 172 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SLC22A3O75751 556 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ITGA1P56199 1179 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 GNA12Q03113 381 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CNSTQ6PJW8 725 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CDC73Q6P1J9 531 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SLC4A5Q9BY07 1137 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa20.38■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 UBXN8O00124 270 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 VAV1P15498 845 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CDC42P60953 191 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NEDD8Q15843 81 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 DHX15O43143 795 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ZMPSTE24O75844 475 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 MED26O95402 600 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 IL10RBQ08334 325 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PEX6Q13608 980 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 GPR158Q5T848 1215 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NETO2Q8NC67 525 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 Q9Y3F1 56 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CD48P09326 243 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 AP1S1P61966 158 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 DGUOKQ16854 277 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ZYG11AQ6WRX3 759 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NTAN1Q96AB6 310 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 TLCD1Q96CP7 247 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CXCR3P49682 368 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 DPYSL2Q16555 572 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 RFX4Q33E94 735 aa20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 LINC00032P0C843 101 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SPAM1P38567 509 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ABRQ12979 859 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NLGN2Q8NFZ4 835 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 KRT36O76013 467 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 TSPAN8P19075 237 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 PDE9AO76083 593 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NTRK1P04629 796 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 USP4Q13107 963 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM40Q6P9F5 258 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 RNFT2Q96EX2 444 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 TCF12Q99081 682 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 NFKBIEO00221 500 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ENTPD5O75356 428 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 GPD2P43304 727 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGAP1Q07960 439 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 ELP6Q0PNE2 266 aa20.36■□□□□ 0.85
LRIG1-201ENST00000273261 SLC1A5Q15758 541 aa20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms