RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 GPR180Q86V85 440 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 MIER2Q8N344 545 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SMYD1Q8NB12 490 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SMOQ99835 787 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 IL22Q9GZX6 179 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 IGSF5Q9NSI5 407 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 FADS3Q9Y5Q0 445 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 HACD1B0YJ81 288 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CNMDO75829 334 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 HGFP14210 728 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CD151P48509 253 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 AGTR2P50052 363 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CATSPER1Q8NEC5 780 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PBXIP1Q96AQ6 731 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PPM1MQ96MI6 270 aa13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ANGPT2O15123 496 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TRIM24O15164 1050 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TGFBR1P36897 503 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 BMXP51813 675 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 MTPNP58546 118 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 MERTKQ12866 999 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TGFBIQ15582 683 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PKN3Q6P5Z2 889 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ITIH5Q86UX2 942 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SLC15A3Q8IY34 581 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ZMIZ2Q8NF64 920 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TFAP2CQ92754 450 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SDCCAG3Q96C92 435 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 EXOC2Q96KP1 924 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 MUS81Q96NY9 551 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SLC39A8Q9C0K1 460 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 WDR70Q9NW82 654 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TRIM43BA6NCK2 446 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TGFB3P10600 412 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TCF3P15923 654 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CD86P42081 329 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 C21orf59P57076 290 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 STX1BP61266 288 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DNASE1L3Q13609 305 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 IHHQ14623 411 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PAGE3Q5JUK9 113 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 MILR1Q7Z6M3 343 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 C3orf58Q8NDZ4 430 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 OR2T34Q8NGX1 318 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 OR2T3Q8NH03 318 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ELMO1Q92556 727 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 C19orf60Q96EN9 201 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DUSP16Q9BY84 665 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 J3KR12 359 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ARPC2O15144 300 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 GFAPP14136 432 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ITGB6P18564 788 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DSC2Q02487 901 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 STX5Q13190 355 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 NR1D2Q14995 579 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SPRYD7Q5W111 196 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 C14orf80Q86SX3 495 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CENPSQ8N2Z9 138 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 LZTR1Q8N653 840 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 FAM86B1Q8N7N1 296 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TBCDQ9BTW9 1192 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 YIPF2Q9BWQ6 316 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 VRTNQ9H8Y1 702 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SMURF2Q9HAU4 748 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 KIAA1257Q9ULG3 409 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 VPS4AQ9UN37 437 aa13□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CRCPO75575 148 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 SLC7A1P30825 629 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ALDH3B2P48448 385 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PHEXP78562 749 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 GALNT3Q14435 633 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 GRAMD4Q6IC98 578 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DENND5AQ6IQ26 1287 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 PELI3Q8N2H9 469 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 RDH11Q8TC12 318 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 DLG3Q92796 817 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 TCF12Q99081 682 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ADAM28Q9UKQ2 775 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 RAD54BQ9Y620 910 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 ADAM23O75077 832 aa12.99□□□□□ -0.33
SNX1-201ENST00000261889 CNTN5O94779 1100 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms