RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261024.6

SLC40A1-201, Transcript of solute carrier family 40 member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC40A1, Length 3,442 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1-201ENST00000261024 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PGM5Q15124 567 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TMEM132AQ24JP5 1023 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SMU1Q2TAY7 513 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 COLEC12Q5KU26 742 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PRR5LQ6MZQ0 368 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PMF1Q6P1K2 205 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 YME1L1Q96TA2 773 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 BDH2Q9BUT1 245 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 IL37Q9NZH6 218 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZNF221Q9UK13 617 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ARSFP54793 590 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SNX17Q15036 470 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TSTD2Q5T7W7 516 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 STEAP3Q658P3 488 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 LCN8Q6JVE9 175 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 FKBP9P1Q75LS8 142 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 CUZD1Q86UP6 607 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 LYSMD2Q8IV50 215 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SLC7A14Q8TBB6 771 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NODALQ96S42 347 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SLC30A3Q99726 388 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SPON1Q9HCB6 807 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 CHST12Q9NRB3 414 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SNTG2Q9NY99 539 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 MAP10Q9P2G4 905 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NOBOXO60393 691 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TNNC2P02585 160 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 THRBP10828 461 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PPP5CP53041 499 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 AP3M2P53677 418 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TNFAIP2Q03169 654 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NIPA1Q7RTP0 329 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 OR13J1Q8NGT2 312 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NGLY1Q96IV0 654 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 C2orf40Q9H1Z8 148 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 DSN1Q9H410 356 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 DPP3Q9NY33 737 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 UBP1Q9NZI7 540 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 COX16Q9P0S2 106 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SATB2Q9UPW6 733 aa14.95□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NRAPQ86VF7 1730 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 MFSD11O43934 449 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 GPIP06744 558 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ACAP2Q15057 778 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PLD3Q8IV08 490 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 GOLM1Q8NBJ4 401 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TMEM176AQ96HP8 235 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 MED30Q96HR3 178 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 OR2B2Q9GZK3 357 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 USP22Q9UPT9 525 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 H0YAE9 185 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TCF3P15923 654 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PSMB9P28065 219 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 NR2C2P49116 596 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 APLP1P51693 650 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 GNG2P59768 71 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 BNIP2Q12982 314 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 CTBP1Q13363 440 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 RPS6KA2Q15349 733 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZNF280DQ6N043 979 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZNF567Q8N184 647 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 C12orf29Q8N999 325 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ANKK1Q8NFD2 765 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ROPN1LQ96C74 230 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ZNF560Q96MR9 790 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TOR3AQ9H497 397 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 ALG2Q9H553 416 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 SP140LQ9H930 580 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC40A1-201ENST00000261024 TBKBP1A7MCY6 615 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms