RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SAP25Q8TEE9 199 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 DTD2Q96FN9 168 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GBA3Q9H227 469 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 KLF15Q9UIH9 416 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 JRKLQ9Y4A0 524 aa22.31■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 LIASO43766 372 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SH3BP5O60239 455 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGA12O60330 932 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CLDN7O95471 211 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 NFKBIAP25963 317 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 TRIM23P36406 574 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 YPEL5P62699 121 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CCDC173Q0VFZ6 552 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 DENND2CQ68D51 928 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SLC35F6Q8N357 371 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 FAM71DQ8N9W8 422 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SPATA13Q96N96 652 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 TMEM121Q9BTD3 319 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ADGRE3Q9BY15 652 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.3■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 K7ESM1 405 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 TOR1BO14657 336 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CBFA2T3O75081 653 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 NDST3O95803 873 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 EPOP01588 193 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ZNF30P17039 623 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CCT8P50990 548 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 STC1P52823 247 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF7Q14155 803 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 WDR24Q96S15 920 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 APOOQ9BUR5 198 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.29■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CACNA1AO00555 2505 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SPTBN2O15020 2390 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GIPC1O14908 333 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GCATO75600 419 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PCCBP05166 539 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PIRTP0C851 137 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PSMB4P28070 264 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 MPP3Q13368 585 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 MTM1Q13496 603 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ZNF542PQ5EBM4 170 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 PNCKQ6P2M8 343 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 GATAD2AQ86YP4 633 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 OXR1Q8N573 874 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 RTP4Q96DX8 246 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 NUS1Q96E22 293 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 IFT43Q96FT9 208 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 OR1A2Q9Y585 309 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.28■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CEP104O60308 925 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 KCNK5O95279 499 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SOD1P00441 154 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 FGGP02679 453 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ADRA1AP35348 466 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 CHRNA4P43681 627 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 DPTQ07507 201 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 KCTD16Q68DU8 428 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 RASGEF1CQ8N431 466 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 DEFB124Q8NES8 71 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 ABCG8Q9H221 673 aa22.27■■□□□ 1.16
SYF2-201ENST00000236273 SPEGQ15772 3267 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 AURKAO14965 403 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 METTL18O95568 372 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 CSF2P04141 144 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 OLIG2Q13516 323 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SLC1A5Q15758 541 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 CCNG2Q16589 344 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SIRPB2Q5JXA9 342 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 RANBP10Q6VN20 620 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 TMC3Q7Z5M5 1100 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 NLRP8Q86W28 1048 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 NAXDQ8IW45 347 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A45Q8N413 288 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 IPMKQ8NFU5 416 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 SCAMP4Q969E2 229 aa22.26■■□□□ 1.15
SYF2-201ENST00000236273 FERMT1Q9BQL6 677 aa22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms