RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000206657.1

Usf2-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Usf2-ps1, Length 311 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Sp110Q8BVK9 445 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Cep68Q8C0D9 733 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Sh3rf3Q8C120 878 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tmem145Q8C4U2 746 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Stbd1Q8C7E7 338 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Lrp11Q8CB67 483 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 ClasrpQ8CFC7 668 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Dennd1cQ8CFK6 786 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Gpr18Q8K1Z6 331 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Fam13bQ8K2H3 851 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Rnf219Q8K2Y0 722 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Mtss1Q8R1S4 759 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Lrrc61Q8R2R5 259 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Lrrc42Q8R2U7 421 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 RhoqQ8R527 205 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 CthQ8VCN5 398 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Bloc1s4Q8VED2 215 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Olfr722Q8VFC8 308 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Zfp617Q91WM0 559 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Vps36Q91XD6 386 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tmem63aQ91YT8 804 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Gprc5bQ923Z0 410 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Pex6Q99LC9 981 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 SncaipQ99ME3 962 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 ClpsQ9CQC2 113 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ankrd1Q9CR42 319 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Nudt17Q9CWD3 296 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Sugt1Q9CX34 336 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Fam212aQ9CX62 282 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Cdkn2aipnlQ9D211 116 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tbc1d21Q9D9D3 336 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tsga13Q9DA17 273 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Grm3Q9QYS2 879 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 SqorQ9R112 450 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Cep250Q60952 2414 aa6.47□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Dock4P59764 1978 aa6.46□□□□□ -1.37
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Gm1141B9EJU1 475 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Atp6ap1lD3Z5W0 336 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 E9Q0B3 247 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ttc7bE9Q6P5 843 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Galnt9G3X942 604 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Sclt1G5E861 688 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Serpinb9O08797 374 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Pik3r2O08908 722 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Cdk14O35495 469 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Kcnu1O54982 1121 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tk1P04184 233 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Dnmt3cP0DOY1 709 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Rpl7aP12970 266 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Atf2P16951 487 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 PdgfaP20033 211 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 F3P20352 294 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Gadd45bP22339 160 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 PtmaP26350 111 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ephx2P34914 554 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 LdlrP35951 862 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Vipr2P41588 437 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Rhox5P52651 210 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Lzts1P60853 599 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Actr1aP61164 376 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Mcl1P97287 331 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Adcy8P97490 1249 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Dok6Q2MHE5 331 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 GsapQ3TCV3 858 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Dpcr1Q3TNW5 500 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Kdm4dQ3U2K5 510 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Hdhd2Q3UGR5 259 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 LchnQ3UHG7 455 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Grm5Q3UVX5 1203 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tmem247Q497K7 211 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Timm8a2Q4FZG7 97 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Slc9b2Q5BKR2 547 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ggt1Q60928 568 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Six4Q61321 775 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Sema5aQ62217 1077 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 ShhQ62226 437 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Tspan7Q62283 249 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 ZpbpQ62522 350 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Bcl2l1Q64373 233 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 PapolgQ6PCL9 739 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Dlgap3Q6PFD5 977 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Snx13Q6PHS6 957 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 SrlQ7TQ48 910 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Gabbr2Q80T41 940 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Arhgef38Q80VK6 770 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Armc12Q80X86 340 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 AW551984Q8BGF0 804 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 SynbQ8BI41 618 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ccdc184Q8BMK5 191 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Sumf2Q8BPG6 308 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Ankk1Q8BZ25 745 aa6.46□□□□□ -1.38
Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 Lrrc4cQ8C031 640 aa6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 78.7 ms