RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029907.5

Ubxn2b-201, Transcript of UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn2b, Length 6,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cilp2D3Z7H8 1162 aa9.61□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 1700024B05RikE9Q6D7 167 aa9.61□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Smoc1Q8BLY1 463 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Morc4Q8BMD7 928 aa9.61□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Nhsl2B1AXH1 854 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr726E9Q8X3 321 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Vmn2r5K7N788 911 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ncam2O35136 837 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Coro1aO89053 461 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 P01810 119 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ncf4P97369 339 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr725Q05A45 321 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 UcmaQ14BU0 138 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Brsk1Q5RJI5 778 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ltbp3Q61810 1268 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sarm1Q6PDS3 724 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zfp606Q7TSV0 794 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Adgrf1Q8VEC3 908 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ap1m2Q9WVP1 423 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Zmynd12A2BGJ5 363 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Vmn2r14E9Q759 848 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 MutP16332 748 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mxd1P50538 227 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Prss53Q571E5 552 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Nfe2l1Q61985 741 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Jak2Q62120 1129 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Stmnd1Q6P3A1 279 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dennd2cQ6P9P8 914 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Smpd4Q6ZPR5 823 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mppe1Q80XL7 396 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fmo9Q8C116 539 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Acad9Q8JZN5 625 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pbld2Q9CXN7 288 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pias4Q9JM05 507 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 LipaQ9Z0M5 397 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 MipepA6H611 711 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pknox1O70477 436 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 P01669 111 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dsc2P55292 902 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cd300lgQ1ERP8 331 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 B3gnt3Q5JCS9 372 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PolnQ7TQ07 864 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Alkbh8Q80Y20 664 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Copg1Q9QZE5 874 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tle2Q9WVB2 767 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gpr25P0C5I1 358 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 RpsaP14206 295 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Sstr3P30935 428 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Neurog1P70660 244 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Mtf2Q02395 593 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pag1Q3U1F9 429 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Akr1clQ3UXL1 322 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Igfbp7Q61581 281 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Xlr3cQ61806 226 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 PisdQ8BSF4 406 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tusc3Q8BTV1 347 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Glod4Q9CPV4 298 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fam90a1bQ9D4F3 419 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gpc1Q9QZF2 557 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 RecqlQ9Z129 648 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cldn24D3YXJ9 220 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Grem1O70326 184 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 4930430A15RikQ05AC5 485 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc39a14Q75N73 489 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Olfr213Q7TS32 327 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Cnksr3Q8BMA3 555 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Dusp6Q9DBB1 381 aa9.6□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ttc30a2A2AKQ8 664 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm3526E9PZM0 191 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 VegfbP49766 207 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Psd2Q6P1I6 770 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ubxn7Q6P5G6 467 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Tmem30aQ8VEK0 364 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ndufb5Q9CQH3 189 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 B9d1Q9R1S0 204 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 HephQ9Z0Z4 1157 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Atg2aQ6P4T0 1914 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm45861A0A1B0GRY3 1923 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pot1bH7BX60 640 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 CidebO70303 219 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 LtfP08071 707 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 CidecP56198 239 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ceacam5Q3UKK2 947 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Fastkd1Q6DI86 829 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 B3gnt5Q8BGY6 376 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ago1Q8CJG1 857 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc6a20aQ8VDB9 592 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rrp15Q9CYX7 281 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Ppil6Q9D6D8 278 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Paip2Q9D6V8 124 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Slc39a5Q9D856 535 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Q9D937 123 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Smad9Q9JIW5 430 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Gm21731A0A286YDE9 180 aa9.59□□□□□ -0.87
Ubxn2b-201ENSMUST00000029907 Rhox2gL7MUB9 191 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms