RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021278.13

Ctc1-201, Transcript of CST complex subunit CTC1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ctc1, Length 4,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1-201ENSMUST00000021278 MertkQ60805 994 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Grm7Q68ED2 915 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 P4ha3Q6W3F0 542 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NrcamQ810U4 1256 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Usp43Q8BUM9 1132 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Taf2Q8C176 1104 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 CenpxQ8C4X1 78 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Alx1Q8C8B0 326 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gfm1Q8K0D5 751 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acvr1cQ8K348 493 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Prdm9Q96EQ9 843 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mtfr1Q99MB2 328 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp811A0A0J9YU71 552 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd300ld2A2A7W0 305 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Znf382B2RXC5 579 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp808B8JJZ4 753 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nek2O35942 443 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Vti1bO88384 232 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Krt2Q3TTY5 707 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Bfsp2Q6NVD9 416 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ckmt2Q6P8J7 419 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arhgap12Q8C0D4 838 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Acot11Q8VHQ9 594 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Uxs1Q91XL3 420 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pih1d1Q9CQJ2 290 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RangrfQ9JIB0 185 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sult1b1Q9QWG7 299 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Lypla2Q9WTL7 231 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pfdn5Q9WU28 154 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Myh7Q91Z83 1935 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam205a1D3YZF6 1314 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pld3O35405 488 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Tap1P21958 724 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cd40lgP27548 260 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gpr182P43142 395 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Aff3P51827 1254 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 UrodP70697 367 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm7030Q0WXH6 285 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Nsun7Q14AW5 724 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyp11b1Q3TG86 501 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hhla1Q3TYV2 514 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Q3UJP5 209 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc27a5Q4LDG0 689 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rassf5Q5EBH1 413 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Akap4Q60662 849 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 PterQ60866 349 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Abcb7Q61102 752 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Epha7Q61772 998 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Creb3Q61817 404 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ppp1r26Q6A025 1163 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 RbfaQ6P3B9 350 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ttyh3Q6P5F7 524 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Atp6v0d2Q80SY3 350 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Carnmt1Q80UY1 400 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Thnsl1Q8BH55 747 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fbxo9Q8BK06 437 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Stxbp5Q8K400 1152 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp566Q8VCI1 386 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Rnh1Q91VI7 456 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Brinp1Q920P3 760 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TfQ921I1 697 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 NanpQ9CPT3 248 aa9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Idh3aQ9D6R2 366 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 C4bP01029 1738 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Fam171a2A2A699 822 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp984A2A7A2 547 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1123A2AT85 323 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm17093F6XGJ4 214 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm19965J3QNY8 723 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Socs2O35717 198 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Mybpc3O70468 1270 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp1P08042 402 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hoxd9P28357 339 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Grik2P39087 908 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dlg3P70175 849 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Xlr4cQ3TKR2 215 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 C1orf109Q499E6 217 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Sox17Q61473 419 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 TbataQ7TSD4 393 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Olfr1346Q8VGH6 313 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Snx10Q9CWT3 201 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Xlr4bQ9JJQ7 215 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Il20Q9JKV9 176 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Foxo4Q9WVH3 505 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Pkd2l1A2A259 760 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Zfp973A2BE20 318 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Ssxb8B1AY40 170 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm3149E9PW52 257 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm37240E9QAY5 252 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Arfip1G5E8V9 373 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Gm8362K7N6Y6 257 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 AvilO88398 819 aa9.26□□□□□ -0.93
Ctc1-201ENSMUST00000021278 Hdac3O88895 424 aa9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.9 ms