RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008297.4

Clstn3-201, Transcript of Calsyntenin-3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Clstn3, Length 4,014 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mob2Q8VI63 235 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mta3Q924K8 591 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nck1Q99M51 377 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cpxm2Q9D2L5 764 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Prorsd1Q9D820 169 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 1700080O16RikQ9D9G4 284 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa9.41□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cylc2B1AWN8 422 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Klhl4B1AZR0 717 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rgs2O08849 211 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cd4P06332 457 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Faf2Q3TDN2 445 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cldn11Q60771 207 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cypt2Q6P924 180 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pnma8aQ80VM8 430 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mab21L3Q8CI17 429 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ago3Q8CJF9 860 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pmf1Q9CPV5 202 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Anks3Q9CZK6 655 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Duoxa2Q9D311 320 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 KelQ9EQF2 713 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slamf1Q9QUM4 343 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 AadatQ9WVM8 425 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cldn24D3YXJ9 220 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Zbtb10E9Q8X5 861 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bub1O08901 1058 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cxcl9P18340 126 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 BrafP28028 804 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 RxraP28700 467 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc6a13P31649 602 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Agtr2P35374 363 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ptger1P35375 405 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il12aP43431 215 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Adra1dP97714 562 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 CkbQ04447 381 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Q32M26 199 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmc5Q32NZ6 967 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spryd7Q3TFQ1 196 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc8bQ5DU41 803 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Glp2rQ5IXF8 512 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Phlda1Q62392 405 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Defa17Q64016 82 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Sgo2Q7TSY8 1164 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fam78aQ8C552 283 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ace2Q8R0I0 805 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gsg1Q8R1W2 324 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 WwoxQ91WL8 414 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Golm1Q91XA2 393 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pin4Q9CWW6 131 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bcas2Q9D287 225 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tmem80Q9D3H0 123 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Plscr2Q9DCW2 307 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr596F8VQ26 312 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm3248K7N721 186 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rgs4O08899 205 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Il4i1O09046 630 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fgf10O35565 209 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 PlaaP27612 794 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Mbl1P39039 239 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Galnt3P70419 633 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Larp7Q05CL8 570 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pag1Q3U1F9 429 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tigd3Q7TM95 470 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Trim17Q7TPM3 477 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Teddm1aQ810U2 305 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Slc5a9Q8VDT1 685 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ca9Q8VHB5 437 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rhox9Q9EQM5 227 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Ttc6G3UYY4 1857 aa9.4□□□□□ -0.9
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Olfr1145A2AVC7 325 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Galntl6E5D8G1 601 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gm10477F6SW83 55 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Calhm3J3QMI4 347 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Bnc1O35914 961 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Svs4P18419 113 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Hoxd10P28359 340 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Acot8P58137 320 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Rnf157Q3TEL6 685 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pgs1Q8BHF7 553 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Thop1Q8C1A5 687 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Tspan8Q8R3G9 235 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nsmce2Q91VT1 247 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Znf622Q91VY9 476 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Oas1cQ924S2 362 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Gins4Q99LZ3 223 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Lrrc4Q99PH1 652 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp6v1g1Q9CR51 118 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Vps28Q9D1C8 221 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fndc8Q9D2H8 321 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Pou5f2Q9DAC9 329 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Spock2Q9ER58 423 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Nt5cQ9JM14 200 aa9.4□□□□□ -0.91
Clstn3-201ENSMUST00000008297 Fzd9Q9R216 592 aa9.4□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.3 ms