RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628374.2

PCBP1-AS1-328, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 766 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TNFP01375 233 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ATP1A3P13637 1013 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 HGFP14210 728 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PNLIPP16233 465 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 GLB1P16278 677 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 DESP17661 470 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ERCC2P18074 760 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PSMA2P25787 234 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 BCL2L1Q07817 233 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 IL10RBQ08334 325 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 STX1AQ16623 288 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 C14orf28Q4W4Y0 310 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SPRED1Q7Z699 444 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SLITRK4Q8IW52 837 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TP53INP2Q8IXH6 220 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 FBXO39Q8N4B4 442 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 FNIP1Q8TF40 1166 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 MED8Q96G25 268 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 COQ10AQ96MF6 247 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TMEM74Q96NL1 305 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PSKH2Q96QS6 385 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LGR4Q9BXB1 951 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 STRADBQ9C0K7 418 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TMEM168Q9H0V1 697 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 MYO6Q9UM54 1294 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SDK2Q58EX2 2172 aa10.25□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LRRK2Q5S007 2527 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PRSS38A1L453 326 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 B4DGG1 531 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 B8ZZF3 427 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 DFFAO00273 331 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 NVLO15381 856 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TEX33O43247 280 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LRCH4O75427 683 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PEX11BO96011 259 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CCDC172P0C7W6 258 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 KELP23276 732 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 MIPP30301 263 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 HCAR3P49019 387 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 AP1S1P61966 158 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PNCKQ6P2M8 343 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ZNF438Q7Z4V0 828 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TAF8Q7Z7C8 310 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 FAM46DQ8NEK8 389 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CCL4L1Q8NHW4 92 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ZNF599Q96NL3 588 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 WDR26Q9H7D7 661 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SP110Q9HB58 689 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 B4GALT6Q9UBX8 382 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SEPT3Q9UH03 358 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LOXL2Q9Y4K0 774 aa10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LRRC53A6NM62 1247 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TMCO5BA8MYB1 307 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 DAPK3O43293 454 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PRPSAP2O60256 369 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SOCS5O75159 536 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LIPCP11150 499 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ITIH1P19827 911 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CR2P20023 1033 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TNFAIP3P21580 790 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ETV5P41161 510 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SCNN1BP51168 640 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 B4GALNT1Q00973 533 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 LBRQ14739 615 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 NR1D2Q14995 579 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 TGIF1Q15583 401 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 CNGA3Q16281 694 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 SASS6Q6UVJ0 657 aa10.23□□□□□ -0.77
PCBP1-AS1-328ENST00000628374 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms