RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616247.4

LMO3-235, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LMO3, Length 3,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-235ENST00000616247 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CALML6Q8TD86 181 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 IL12RB2Q99665 862 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MED10Q9BTT4 135 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CHID1Q9BWS9 393 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RHOJQ9H4E5 214 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LRRC4Q9HBW1 653 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 VTA1Q9NP79 307 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MID1IP1Q9NPA3 183 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DPP3Q9NY33 737 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MDM4O15151 490 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GSTA4O15217 222 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PGK1P00558 417 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GFAPP14136 432 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HGFP14210 728 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ERCC2P18074 760 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MAGEA6P43360 314 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 APLP1P51693 650 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 VBP1P61758 197 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ECT2LQ008S8 904 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LAPTM5Q13571 262 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PHKG1Q16816 387 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SLC36A3Q495N2 470 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C6orf10Q5SRN2 563 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FAM117BQ6P1L5 589 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 AKAP14Q86UN6 197 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TRPV3Q8NET8 790 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 STYXQ8WUJ0 223 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNF347Q96SE7 839 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 OLFM1Q99784 485 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FSD1LQ9BXM9 530 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RNF38Q9H0F5 515 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NANOGQ9H9S0 305 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TRIM39Q9HCM9 518 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 AASSQ9UDR5 926 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 METRNQ9UJH8 293 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NUDT5Q9UKK9 219 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PCNTO95613 3336 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LAMB2P55268 1798 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 H0YJX3 145 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 VWA5AO00534 786 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 HS6ST1O60243 411 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 INMTO95050 263 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ALOX12P18054 663 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 PRKACGP22612 351 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ATICP31939 592 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SHMT2P34897 504 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RBP5P82980 135 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LIPEQ05469 1076 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TNK2Q07912 1038 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DPYSL2Q16555 572 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LY6KQ17RY6 165 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ZNF773Q6PK81 442 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SPESP1Q6UW49 350 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 LCLAT1Q6UWP7 414 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ABI1Q8IZP0 508 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 RDH11Q8TC12 318 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NCLNQ969V3 563 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 ITPKCQ96DU7 683 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 BDH2Q9BUT1 245 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 FICDQ9BVA6 458 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 IL22Q9GZX6 179 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 GBA3Q9H227 469 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 DPEP3Q9H4B8 488 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 MINDY3Q9H8M7 445 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 SUN2Q9UH99 717 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CDH7Q9ULB5 785 aa6.69□□□□□ -1.34
LMO3-235ENST00000616247 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms