RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 MIPP30301 263 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CCKBRP32239 447 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CSNK1DP48730 415 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 INHBCP55103 352 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 DPYSQ14117 519 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TGIF1Q15583 401 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CERCAMQ5T4B2 595 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 DPPA4Q7L190 304 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RAB11FIP2Q7L804 512 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SPRED1Q7Z699 444 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 FBXO39Q8N4B4 442 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 OR56A4Q8NGH8 313 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 TMEM168Q9H0V1 697 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 LRRN3Q9H3W5 708 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 SP110Q9HB58 689 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 CBX8Q9HC52 389 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 PISDQ9UG56 409 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 RNF215Q9Y6U7 377 aa12.15□□□□□ -0.46
CTIF-208ENST00000590422 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SDK2Q58EX2 2172 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SPTA1P02549 2419 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TMEM191CA6NGB0 347 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LRRC53A6NM62 1247 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LRCH4O75427 683 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TNFP01375 233 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TCF4P15884 667 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ITIH1P19827 911 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TRIM23P36406 574 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SCNN1BP51168 640 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 BCL2L1Q07817 233 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SLC10A7Q0GE19 358 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ERMARDQ5T6L9 678 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CCDC81Q6ZN84 652 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TAF8Q7Z7C8 310 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 JAMLQ86YT9 394 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PGBD5Q8N414 524 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 AOPEPQ8N6M6 819 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 FAM46DQ8NEK8 389 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ATL2Q8NHH9 583 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 WDR26Q9H7D7 661 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CYP4F12Q9HCS2 524 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PARVAQ9NVD7 372 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 WDR70Q9NW82 654 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 B4GALT6Q9UBX8 382 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 APPL1Q9UKG1 709 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LOXL2Q9Y4K0 774 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 BSNQ9UPA5 3926 aa12.14□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
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CTIF-208ENST00000590422 CFAP69A5D8W1 941 aa12.13□□□□□ -0.47
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CTIF-208ENST00000590422 DAPK3O43293 454 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PEX11BO96011 259 aa12.13□□□□□ -0.47
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CTIF-208ENST00000590422 GLB1P16278 677 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 DESP17661 470 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TNFAIP3P21580 790 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 LHCGRP22888 699 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 IL1R2P27930 398 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ETV5P41161 510 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 MAZP56270 477 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 AP1S1P61966 158 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
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CTIF-208ENST00000590422 C14orf28Q4W4Y0 310 aa12.13□□□□□ -0.47
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CTIF-208ENST00000590422 OGFOD3Q6PK18 319 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 SLITRK4Q8IW52 837 aa12.13□□□□□ -0.47
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CTIF-208ENST00000590422 PSKH2Q96QS6 385 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 STRADBQ9C0K7 418 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ETNK2Q9NVF9 386 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 DONSONQ9NYP3 566 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 FOXJ2Q9P0K8 574 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 ACSL6Q9UKU0 697 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa12.13□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa12.12□□□□□ -0.47
CTIF-208ENST00000590422 A0A0U1RQS6 177 aa12.12□□□□□ -0.47
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