RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568445.1

CENPN-208, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 5

Gene CENPN, Length 591 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-208ENST00000568445 CUL4BQ13620 913 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CST6Q15828 149 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SLC14A2Q15849 920 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 FIGNQ5HY92 759 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CHST9Q7L1S5 443 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SCD5Q86SK9 330 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 TMEM139Q8IV31 216 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 FUKQ8N0W3 1084 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MYCT1Q8N699 235 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 UBR7Q8N806 425 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 PDILTQ8N807 584 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 WFDC5Q8TCV5 224 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GANCQ8TET4 914 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 STRA6Q9BX79 667 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ASPNQ9BXN1 380 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 RAB34Q9BZG1 259 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ABCG4Q9H172 646 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 COMMD8Q9NX08 183 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 NLGN3Q9NZ94 848 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 KCND2Q9NZV8 630 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 FZD4Q9ULV1 537 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SCML1Q9UN30 329 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MRFAP1Q9Y605 127 aa6.52□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 A0A1W2PQH9 124 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CTAGE9A4FU28 777 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GOLGA8IPA6NC78 632 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 HHLA1C9JL84 531 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SCAMP1O15126 338 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MFAP3LO75121 409 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CLDN1O95832 211 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SCGB1D2O95969 90 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 RARGP13631 454 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 HGFP14210 728 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 SLC8A1P32418 973 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 DRD3P35462 400 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 UGT1A5P35504 534 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CHKAP35790 457 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 UBA7P41226 1012 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 METAP1P53582 386 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CDK17Q00537 523 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 OVGP1Q12889 678 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MPP2Q14168 576 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 E2F5Q15329 346 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CDKN3Q16667 212 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 LONRF2Q1L5Z9 754 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MANEAQ5SRI9 462 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 GK5Q6ZS86 529 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CCDC170Q8IYT3 715 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 CPXM2Q8N436 756 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 PAF1Q8N7H5 531 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 OR14C36Q8NHC7 312 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 DHX58Q96C10 678 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MAP6Q96JE9 813 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 LMLNQ96KR4 655 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.51□□□□□ -1.37
CENPN-208ENST00000568445 EDEM3Q9BZQ6 932 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms