RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 FEM1CQ96JP0 617 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PRORYQ9H606 182 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDH12Q9NPG4 1184 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC66A2RUB6 948 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NEMP2A6NFY4 417 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 IGLON5A6NGN9 336 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNK1O00180 336 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RAD51BO15315 384 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SDC3O75056 442 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKCGP05129 697 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HLA-DQB2P05538 268 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DGKAP23743 735 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ITPKBP27987 946 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SUOXP51687 545 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BCL2L1Q07817 233 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAF2Q12933 501 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB17Q13105 803 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TFDP2Q14188 446 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PDK1Q15118 436 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ODF2Q5BJF6 829 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 KAZNQ674X7 775 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BBS5Q8N3I7 341 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TXLNBQ8N3L3 684 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC25A45Q8N413 288 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CCNYQ8ND76 341 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SEMA3CQ99985 751 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC17A9Q9BYT1 436 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 USP29Q9HBJ7 922 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 FZD3Q9NPG1 666 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 AMACRQ9UHK6 382 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TRIM38O00635 465 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 SOCS5O75159 536 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 FTCDO95954 541 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MT-CO3P00414 261 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 JCHAINP01591 159 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PTPN7P35236 360 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP12P39900 470 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NR2C2P49116 596 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 AADACL2Q6P093 401 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF662Q6ZS27 426 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BBS12Q6ZW61 710 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ASB12Q8WXK4 309 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CRELD1Q96HD1 420 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MYOCQ99972 504 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HEMGNQ9BXL5 484 aa20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 BRINP1O60477 761 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP20O60882 483 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PYGMP11217 842 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CKMT1AP12532 417 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TGM2P21980 687 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 COPS2P61201 443 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DSC2Q02487 901 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RALGDSQ12967 914 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TBC1D25Q3MII6 688 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 PEX26Q7Z412 305 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 LSMEM2Q8N112 164 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 AMFRQ9UKV5 643 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 NEMP1O14524 444 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 FZD6O60353 706 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 GP1BAP07359 652 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP2P08253 660 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 RWDD2BP57060 319 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 CLDN2P57739 230 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-210ENST00000559586 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms