RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 C14orf28Q4W4Y0 310 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 AFMIDQ63HM1 303 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SASS6Q6UVJ0 657 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 CLEC17AQ6ZS10 378 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TMEM168Q9H0V1 697 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 WDR26Q9H7D7 661 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 CYP4F12Q9HCS2 524 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 LRIT1Q9P2V4 623 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PCSK1NQ9UHG2 260 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 MOSPD1Q9UJG1 213 aa24■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 RNF8O76064 485 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 LIPCP11150 499 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ERCC2P18074 760 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 RENBPP51606 427 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 AP1S1P61966 158 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ACOX1Q15067 660 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PNCKQ6P2M8 343 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 USP53Q70EK8 1073 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SPRED1Q7Z699 444 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 CMKLR1Q99788 373 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ANO10Q9NW15 660 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SEPT10Q9P0V9 454 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 RNF215Q9Y6U7 377 aa23.99■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TENM4Q6N022 2769 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 A8MX80 341 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 EFSO43281 561 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TGIF1Q15583 401 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 KIAA1524Q8TCG1 905 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SGF29Q96ES7 293 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 LGR4Q9BXB1 951 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TAS2R14Q9NYV8 317 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SEPT3Q9UH03 358 aa23.98■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PRSS38A1L453 326 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 TEX33O43247 280 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PRPSAP2O60256 369 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ITIH1P19827 911 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SFTPA2Q8IWL1 248 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 NPWQ8N729 165 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 CCL4L1Q8NHW4 92 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PSKH2Q96QS6 385 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PEBP4Q96S96 227 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 KCTD5Q9NXV2 234 aa23.97■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 AGRPO00253 132 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 SLC28A2O43868 658 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PRAMEF10O60809 474 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 GM2AP17900 193 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 NFKBIAP25963 317 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 LBRQ14739 615 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 STX1AQ16623 288 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PHF19Q5T6S3 580 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 LZTR1Q8N653 840 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 NUS1Q96E22 293 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 B4GALT6Q9UBX8 382 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 MYO6Q9UM54 1294 aa23.96■■□□□ 1.43
PBX1-217ENST00000559578 A0A1W2PQ67 120 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 TMEM191CA6NGB0 347 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 MIPP30301 263 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 HCAR3P49019 387 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 MAPK10P53779 464 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 MAP9Q49MG5 647 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 MANEAQ5SRI9 462 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 TMCO4Q5TGY1 634 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 XKR5Q6UX68 686 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 SPOCK2Q92563 424 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 ZNF599Q96NL3 588 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 SYT11Q9BT88 431 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 GSDMCQ9BYG8 508 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 ZWILCHQ9H900 591 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa23.95■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 ZW10O43264 779 aa23.94■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 ITGB2P05107 769 aa23.94■■□□□ 1.42
PBX1-217ENST00000559578 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms