RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 COX16Q9P0S2 106 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCSK1NQ9UHG2 260 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLCA2Q9UQC9 943 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.67□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRD1A4D1F6 860 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR6C75A6NL08 312 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 HHLA1C9JL84 531 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 H7C4K7 107 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CES2O00748 559 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSTPIP1O43586 416 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRCH4O75427 683 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DAB1O75553 588 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF8O76064 485 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 OAZ2O95190 189 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TYRP1P17643 537 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAPN2P17655 700 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DESP17661 470 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SDC4P31431 198 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 BMPR1AP36894 532 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SULT1E1P49888 294 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PEX5P50542 639 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TERF1P54274 439 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMD5Q16401 504 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC14Q49A88 953 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 EFHC1Q5JVL4 640 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 KAZNQ674X7 775 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DEFB106AQ8N104 65 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPATA4Q8NEY3 305 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ACTRT1Q8TDG2 376 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM172AQ8WUF8 416 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGSF21Q96ID5 467 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSFY1Q96LI6 401 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TBCBQ99426 244 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT12Q99456 494 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNPY3Q9BT09 278 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 VN1R3Q9BXE9 311 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TEX101Q9BY14 249 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CARD9Q9H257 536 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRDM13Q9H4Q3 707 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASNSD1Q9NWL6 643 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CDY1Q9Y6F8 540 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.66□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTMR11A4FU01 709 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DIRC3C9JPN6 131 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 E7ENQ6 273 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYNC1I1O14576 645 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CAPN9O14815 690 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ADAM12O43184 909 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRPSAP2O60256 369 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSF2BPO75031 334 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZBED1O96006 694 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 URODP06132 367 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 RALAP11233 206 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRT10P13645 584 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL1R2P27930 398 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 MIPP30301 263 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 CETN2P41208 172 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC5A3P53794 718 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 MANFP55145 182 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 NRG3P56975 720 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 C21orf58P58505 322 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DAOAP59103 153 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYNLT1P63172 113 aa5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP3-AS1-202ENST00000559357 NHLH2Q02577 135 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms