RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555668.5

GPHN-210, Transcript of gephyrin, humanhuman

TSL 4

Gene GPHN, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHN-210ENST00000555668 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SLC22A2O15244 555 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PPM1DO15297 605 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 KCNQ3O43525 872 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 BRINP1O60477 761 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TBX10O75333 385 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SPAG7O75391 227 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 KRT37O76014 449 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CIAO1O76071 339 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 LTFP02788 710 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SOD2P04179 222 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 KRT8P05787 483 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 URODP06132 367 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 RB1P06400 928 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CKMP06732 381 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CD48P09326 243 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 WEE2P0C1S8 567 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 MYL4P12829 197 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ZNF20P17024 532 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ZNF23P17027 643 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 GJA1P17302 382 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 RAB3AP20336 220 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ITGALP20701 1170 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PCSK6P29122 969 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ACSL1P33121 698 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 HSD17B3P37058 310 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 HNF4AP41235 474 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ALDH3B2P48448 385 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PCP4P48539 62 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 NEK3P51956 506 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TPTEP56180 551 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PPP2CBP62714 309 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TNNC1P63316 161 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PPP2CAP67775 309 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 KCNJ10P78508 379 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 GALK2Q01415 458 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 UBE3AQ05086 875 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 DOC2AQ14183 400 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SPARCL1Q14515 664 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ZNF846Q147U1 533 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CDK10Q15131 360 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PPA1Q15181 289 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SGCAQ16586 387 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 LRIT3Q3SXY7 679 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 GTDC1Q4AE62 458 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TEX30Q5JUR7 227 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 BEND3Q5T5X7 828 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PXDC1Q5TGL8 231 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 MZT2AQ6P582 158 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 XKRXQ6PP77 449 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ARSKQ6UWY0 536 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SPATC1Q76KD6 591 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SLC9B2Q86UD5 537 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TLK2Q86UE8 772 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TDRPQ86YL5 185 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 WDR49Q8IV35 697 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SLC22A9Q8IVM8 553 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 MICU2Q8IYU8 434 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ZNF34Q8IZ26 560 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 TAGAPQ8N103 731 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CLEC4FQ8N1N0 589 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CCDC33Q8N5R6 958 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 FITM2Q8N6M3 262 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PLD5Q8N7P1 536 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ICA1LQ8NDH6 482 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SLC17A8Q8NDX2 589 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ZNF398Q8TD17 642 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 POMGNT1Q8WZA1 660 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 SHC3Q92529 594 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 KRT35Q92764 455 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 DPF2Q92785 391 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 LPPQ93052 612 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PHF21AQ96BD5 680 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 C19orf60Q96EN9 201 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PHACTR3Q96KR7 559 aa4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
GPHN-210ENST00000555668 PLIN2Q99541 437 aa4.09□□□□□ -1.75
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