RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 IL12RB2Q99665 862 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CEP41Q9BYV8 373 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PHTF1Q9UMS5 762 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PPIL1Q9Y3C6 166 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TTLL3Q9Y4R7 772 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 U3KQA8 63 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 A0A1W2PQ67 120 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 K7ESM1 405 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 SCAMP1O15126 338 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 GCATO75600 419 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 MMP2P08253 660 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ALPIP09923 528 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 MYF5P13349 255 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CTPS1P17812 591 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CDC25BP30305 580 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 KATNAL2Q8IYT4 538 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 SCRN2Q96FV2 425 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 APOOQ9BUR5 198 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 AMACRQ9UHK6 382 aa20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 KNTC1P50748 2209 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 A0A0U1RQJ8 604 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TOR1BO14657 336 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CKMT2P17540 419 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 MTM1Q13496 603 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PTK2BQ14289 1009 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 NFATC4Q14934 902 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ACOX1Q15067 660 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ALG11Q2TAA5 492 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 RFLNAQ6ZTI6 216 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 SPC24Q8NBT2 197 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 LRRC61Q9BV99 259 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 NLGN3Q9NZ94 848 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.92■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 AQP9O43315 295 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 RFPL3O75679 317 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 HNF1BP35680 557 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ETV3P41162 512 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PEX5P50542 639 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 SKOR1P84550 965 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 AP1B1Q10567 949 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 C1orf61Q13536 156 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PDK1Q15118 436 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 KAZNQ674X7 775 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 DAAM2Q86T65 1068 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 LMX1AQ8TE12 382 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CLPBQ9H078 707 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CHKBQ9Y259 395 aa20.91■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 FAM149AA5PLN7 773 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 H3BM21 787 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CST8O60676 142 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CES1P23141 567 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TRIM23P36406 574 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CD86P42081 329 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 VAV2P52735 878 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 DEFB133Q30KQ1 61 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 DENND2CQ68D51 928 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 USP45Q70EL2 814 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 DTD2Q96FN9 168 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PDXPQ96GD0 296 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 APOLD1Q96LR9 279 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 LGR4Q9BXB1 951 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 APC2O95996 2303 aa20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
CS-222ENST00000550996 PTPRBP23467 1997 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 A0A0J9YYE9 177 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 TMEM202A6NGA9 273 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 PJA2O43164 708 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 TRBC1P01850 177 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 PROS1P07225 676 aa20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
CS-222ENST00000550996 ACP1P24666 158 aa20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms