RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP45Q92619 1136 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM186Q96B77 213 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 HES6Q96HZ4 224 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NSMCE2Q96MF7 247 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 USP28Q96RU2 1077 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRRX2Q99811 253 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA3CQ99985 751 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KATNBL1Q9H079 304 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM206Q9H813 350 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SYNPO2LQ9H987 977 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SCPEP1Q9HB40 452 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IL21RQ9HBE5 538 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
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SYF2P1-201ENST00000550658 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ARL8BQ9NVJ2 186 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RIC8BQ9NVN3 520 aa3.6□□□□□ -1.83
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SYF2P1-201ENST00000550658 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DONSONQ9NYP3 566 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ERAP1Q9NZ08 941 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CAPN11Q9UMQ6 739 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 C15orf41Q9Y2V0 281 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TESMINQ9Y4I5 508 aa3.6□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MAGEB16A2A368 324 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2A25A4D2G3 310 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OR6C74A6NCV1 312 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 A8MZ25 164 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PLK4O00444 970 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 MEIS2O14770 477 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PPEF2O14830 753 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TGFB1I1O43294 461 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SCGB2A1O75556 95 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OR2C1O95371 312 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 POP4O95707 220 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 DDAH2O95865 285 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ONECUT2O95948 504 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 IL18BPO95998 194 aa3.59□□□□□ -1.83
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SYF2P1-201ENST00000550658 RALBP11234 206 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PCNAP12004 261 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CD19P15391 556 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 AREGP15514 252 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 EPORP19235 508 aa3.59□□□□□ -1.83
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SYF2P1-201ENST00000550658 GPTP24298 496 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NR2F2P24468 414 aa3.59□□□□□ -1.83
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SYF2P1-201ENST00000550658 ECHS1P30084 290 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SFNP31947 248 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TTKP33981 857 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SREBF1P36956 1147 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CCR3P51677 355 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 UFM1P61960 85 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NOP14P78316 857 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 SLC6A3Q01959 620 aa3.59□□□□□ -1.83
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SYF2P1-201ENST00000550658 ITIH3Q06033 890 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 NIPAL4Q0D2K0 466 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 OVGP1Q12889 678 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PDCLQ13371 301 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ATP1A4Q13733 1029 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TUBA3CQ13748 450 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 KCNC3Q14003 757 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 COTL1Q14019 142 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGEF7Q14155 803 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 CSHL1Q14406 222 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF273Q14593 569 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PTPAQ15257 358 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TAZQ16635 292 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF789Q5FWF6 425 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.59□□□□□ -1.83
SYF2P1-201ENST00000550658 PRAMEF20Q5VT98 475 aa3.59□□□□□ -1.83
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