RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 AGBL4Q5VU57 503 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 STEAP4Q687X5 459 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SDE2Q6IQ49 451 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CASC4Q6P4E1 433 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EMBQ6PCB8 327 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 BRAT1Q6PJG6 821 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CRTC1Q6UUV9 634 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UNC5AQ6ZN44 842 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SYT13Q7L8C5 426 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RELL1Q8IUW5 271 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SYNPOQ8N3V7 929 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 OR13C4Q8NGS5 318 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ANKRD7Q92527 254 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CFAP36Q96G28 342 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HHIPQ96QV1 700 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RANBP9Q96S59 729 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LYSMD1Q96S90 227 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 KIFC1Q9BW19 673 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 IL22Q9GZX6 179 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TREX1Q9NSU2 369 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.17□□□□□ -1.15e-7■■■□□ 17.4
CS-216ENST00000549221 BFARQ9NZS9 450 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SOX13Q9UN79 622 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 STK25O00506 426 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 GPR39O43194 453 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 RIPK2O43353 540 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ACSL3O95573 720 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 F7P08709 466 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PGAM1P18669 254 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 C5AR1P21730 350 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ADRA1DP25100 572 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CA5AP35218 305 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HSD17B3P37058 310 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NEK3P51956 506 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PMS2P54278 862 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM193AP78312 1265 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TMPRSS15P98073 1019 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CRYMQ14894 314 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NUMA1Q14980 2115 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 E2F5Q15329 346 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 CNGA3Q16281 694 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 PCID2Q5JVF3 399 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 LRRC66Q68CR7 880 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 ANO7Q6IWH7 933 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-216ENST00000549221 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DSG4Q86SJ6 1040 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TTC7BQ86TV6 843 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 TMEM135Q86UB9 458 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 MREGQ8N565 214 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-216ENST00000549221 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 BRSK1Q8TDC3 778 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 HCAR2Q8TDS4 363 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-216ENST00000549221 HMGB4Q8WW32 186 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
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CS-216ENST00000549221 SCRN2Q96FV2 425 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 NELL2Q99435 816 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-216ENST00000549221 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 EBF1Q9UH73 591 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.16□□□□□ -1.1
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CS-216ENST00000549221 BPTFQ12830 3046 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PQ67 120 aa8.15□□□□□ -1.1
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