RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533249.5

PKP3-210, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 3

Gene PKP3, Length 1,111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-210ENST00000533249 SFTPA2Q8IWL1 248 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 NPWQ8N729 165 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 ECHDC3Q96DC8 303 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TMEM74Q96NL1 305 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SYT11Q9BT88 431 aa22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 UNC13CQ8NB66 2214 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 B4DGG1 531 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PRPSAP2O60256 369 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 RNF8O76064 485 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 ATP1A3P13637 1013 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 KELP23276 732 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SCNN1BP51168 640 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 IL10RBQ08334 325 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 NCAPHQ15003 741 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 ACOX1Q15067 660 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 DPPA4Q7L190 304 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TRIM7Q9C029 511 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PISDQ9UG56 409 aa22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TEX33O43247 280 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 NOBOXO60393 691 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 JMJD7P0C870 316 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 MIPP30301 263 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CCKBRP32239 447 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TP53INP2Q8IXH6 220 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 RNF214Q8ND24 703 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 NSMCE3Q96MG7 304 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 LGR4Q9BXB1 951 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 WDR26Q9H7D7 661 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CBX8Q9HC52 389 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa22.92■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 J3QKU1 62 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 GLB1P16278 677 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 GM2AP17900 193 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 AP1S1P61966 158 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TGIF1Q15583 401 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PELI3Q8N2H9 469 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 B4GALT6Q9UBX8 382 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SEPT3Q9UH03 358 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 APPL1Q9UKG1 709 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 LOXL2Q9Y4K0 774 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 RNF215Q9Y6U7 377 aa22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 LRRC53A6NM62 1247 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TNFRSF10CO14798 259 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 KRT10P13645 584 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TRIM23P36406 574 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 RENBPP51606 427 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 ARHGEF7Q14155 803 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 TMCO4Q5TGY1 634 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PNCKQ6P2M8 343 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SPRED1Q7Z699 444 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 PSKH2Q96QS6 385 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 MYO6Q9UM54 1294 aa22.9■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa22.89■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.89■■□□□ 1.26
PKP3-210ENST00000533249 EFSO43281 561 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 ITIH1P19827 911 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 ASIC2Q16515 512 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 DENND2CQ68D51 928 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 NUS1Q96E22 293 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 MED8Q96G25 268 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.89■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 PRSS38A1L453 326 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 B8ZZF3 427 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 LRCH4O75427 683 aa22.88■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PKP3-210ENST00000533249 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms