RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 A0A0J9YYE9 177 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 PCNX2A6NKB5 2137 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 PSMD11O00231 422 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 SH3BP5O60239 455 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 TRBC1P01850 177 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 ITGAVP06756 1048 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 MMP2P08253 660 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 CTPS1P17812 591 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 THOP1P52888 689 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 PFN3P60673 137 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 YPEL5P62699 121 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 PTK2BQ14289 1009 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 SLC14A2Q15849 920 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 CNGA3Q16281 694 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 LPCAT1Q8NF37 534 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 IFT43Q96FT9 208 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.121e-15■□□□□ 9.9
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PTPRK-222ENST00000532751 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 GPR27Q9NS67 375 aa22.02■■□□□ 1.12
PTPRK-222ENST00000532751 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 RBP3P10745 1247 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 WASHC5Q12768 1159 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 IHHQ14623 411 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 RPS6KA1Q15418 735 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 WSCD2Q2TBF2 565 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 DENND2CQ68D51 928 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 PID1Q7Z2X4 250 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 TRIM58Q8NG06 486 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 TRHDEQ9UKU6 1024 aa22.01■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 PRLP01236 227 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 PCCBP05166 539 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 ALPIP09923 528 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF30P17039 623 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 RBL1P28749 1068 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 HNF1BP35680 557 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 GRK6P43250 576 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 MTM1Q13496 603 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 SHBQ15464 509 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 PARGQ86W56 976 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF567Q8N184 647 aa22■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 CAPN8A6NHC0 703 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 STK10O94804 968 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 NFKB1P19838 968 aa21.99■■□□□ 1.11
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PTPRK-222ENST00000532751 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 FAM182AQ5T1J6 154 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 SAP25Q8TEE9 199 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 NUS1Q96E22 293 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 COQ10AQ96MF6 247 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 FAM153AQ9UHL3 310 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa21.99■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 DCHS1Q96JQ0 3298 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD66B4E2M5 251 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 H3BM21 787 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 GIPC1O14908 333 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 GM2AP17900 193 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 HTR1BP28222 390 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 CDK18Q07002 472 aa21.98■■□□□ 1.11
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PTPRK-222ENST00000532751 FZD2Q14332 565 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 INPP5AQ14642 412 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 PCSK7Q16549 785 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC66Q68CR7 880 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 CRTC1Q6UUV9 634 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 TSPAN33Q86UF1 283 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA22Q8NHS9 363 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 CAMK1GQ96NX5 476 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 FCRL5Q96RD9 977 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 LYSMD1Q96S90 227 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 FAM118BQ9BPY3 351 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 APOOQ9BUR5 198 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC28Q9NX36 388 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 RSPH14Q9UHP6 348 aa21.98■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 KCNN4O15554 427 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 ZSCAN12O43309 604 aa21.97■■□□□ 1.11
PTPRK-222ENST00000532751 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.111e-9■■■■■ 28.4
PTPRK-222ENST00000532751 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
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